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Enregistrement W2967276088 · doi:10.20381/ruor-23496

A Multivariate Approach to Integration of Ethnobotanical, Pharmacological, and Phytochemical Analyses of Cree and Squamish Traditional Herbal Medicines for Anti-Diabetes Use

2019· dissertation· en· W2967276088 sur OpenAlexaboutno aff
B Hall

Notice bibliographique

RevueuO Research (University of Ottawa) · 2019
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEthnobotanical and Medicinal Plants Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhytochemicalEthnobotanyTraditional medicineMedicineMultivariate statisticsDiabetes mellitusMedicinal plantsComputer scienceMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This thesis investigated the integration of pharmacological and phytochemical data of medicinal plants from the Cree of Eeyou Istchee in Northern Quebec. Data from these 17 plant extracts were assessed for patterns of biological activity and chemical signals that could be explained by taxonomic or plant organ groupings. The Squamish medicinal plant Oplopanax horridus (Sm.) Miq. was also assessed for enzyme inhibition activity across multiple extracts and for bioactive compounds using an untargeted metabolomics approach. A comprehensive data set was assembled documenting the relative activities on the 17 plant extracts in 69 cell-free and cell-based bioassays covering activity on glucohomeostasis, effects of hyperglycemia, and capacity for enzyme inhibition. Multivariate analysis suggests that the leaf part extracts are particularly associated with antioxidant and antiglycation activities, while another discrete group of extracts associate strongly with other sets of glucohomeostasis assays. The activity of extracts on enzyme inhibition appears to be the factor most strongly driving the majority of activity patterns, likely because extracts that interact strongly with more metabolic enzymes will have more effects on other targets in the body. The phytochemical profiles of the Cree medicinal plants were assessed in two ways. First, spectroscopic and chromatographic data for the plant extracts was compared to a database of phytochemical standards using a proprietary Waters software, UNIFI, to match known signals of chemical standards to unidentified peaks in the plant extracts. Second, similarly collected spectroscopic data for the Cree plant extracts was processed using the software MZMine for multivariate analysis in R, revealing the chemical diversity of the bark extracts in relation to the fruit and leaf extracts. Additionally, marker signals were determined for major sample groupings, and the capacity for this analytical approach to be used to tentatively identify unique compounds was demonstrated. Through bioassay guided fractionation of the O. horridus inner bark extract using the CYP 3A4 inhibition assay, the DCM subfraction midway through the non-polar elution on open column chromatography was determined to be the most potent. This fraction contained 10 major peaks on HPLC-DAD analysis. The hot water extract was found to have negligible activity on CYP 3A4 inhibition. Together, this research provides the first integrated look at the pharmacological and phytochemical data from across the Cree anti-diabetic medicinal plants in a statistical way, as well as providing a first look at O. horridus for inclusion in the anti-diabetes project.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,981
Score d'incertitude au seuil0,037

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0060,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,260
Tête enseignante GPT0,384
Écart entre enseignants0,123 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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