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Enregistrement W2967321104 · doi:10.1200/jco.2009.27.15_suppl.e19537

DNA methylation status of Smurf2 promoter in patients with multiple myeloma

2009· article· en· W2967321104 sur OpenAlexaff
Eleftheria Hatzimichael, Aggeliki Dasoula, Justin Stebbing, George Dranitsaris, T.J. Crook, Konstantinos L. Bourantas

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineDNA methylationMultiple myelomaMethylationCancer researchSMADBone marrowEpigeneticsMolecular biologyInternal medicineTransforming growth factorGeneBiologyGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e19537 Background: Multiple myeloma (MM) is an incurable interleukin (IL)-6 dependent plasma-cell malignancy. Transforming growth factor-β (TGF-β) is the major inducer of IL-6 secretion by bone marrow stromal cells. The signaling responses to TGF-b are mediated by the Smad proteins. The Smurf2 gene (Smad ubiqitiniation regulatory factor 2) encodes a Smad-specific E3 ubiquitin ligase and targets Smad2 and Smad3 for proteasome-dependent degradation. Methods: Bone marrow samples from individuals with MM were obtained at diagnosis and in 5 cases at disease progression as well. Genomic DNA was isolated and bisulphite modification was performed using commercially available kits. The methylation-specific polymerase chain reaction was employed to study the methylation status of the CpG island. Logistic regression analysis was used to measure the association between gene methylation and the development of advanced disease (DS≥ II), extramedullary disease, bone disease, anemia (Hb 10 mg/dl), serum albumin and beta 2 microglobulin levels. Results: We analysed the methylation of Smurf2 in 45 cases of MM (24 male, 21 female, mean age 66.4 years). No sample from the control population was found methylated. The Smurf2 gene promoter was found to be methylated in 11/45 MM patients (24%). Interesting trends were noted where patients with methylated Smurf2 promoter had an increased risk of death (HR = 1.3; p = 0.68), anemia (OR=2.1, p=0.2) and advanced stage (OR=1.3, p=0.6) and a reduced risk of extramedullary disease (OR= 0.2, p=0.2). No association was found between Smurf2 methylation status and bone lytic lesions, serum albumin levels or beta-2 microglobulin levels. Conclusions: Interesting associations between Smurf2 methylation and some relevant clinical parameters in patients with MM were suggested by the data. These findings warrant further evaluation in a larger sample of patients in order to enhance our statistical power and better define the prognostic and clinical value of Smurf2 methylation in MM. No significant financial relationships to disclose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,420
Score d'incertitude au seuil0,258

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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