Lost in Transportation: Calcium Oxalate Crystals in Kidney Biopsy Specimens Fixed in Michel Medium May Disappear
Notice bibliographique
Résumé
Context.— Calcium oxalate (CaOx) deposits in a kidney biopsy specimen can be seen in acute or chronic kidney injury and in oxalate nephropathy. Although no established cutoff criteria to diagnose oxalate nephropathy versus incidental CaOx deposition in the kidney exist, these conditions require different treatment. We noticed a significant decrease in the number of CaOx deposits in the kidney biopsy cores that were fixed in Michel transport medium (MTM) as compared to their counterparts fixed in formalin. Objective.— To investigate the impact of different fixatives on the number of CaOx deposits in kidney biopsy specimens. Design.— Retrospective search for kidney biopsies with diagnosis of CaOx deposition was performed in our Renal Pathology Database between January 1, 2015 and October 15, 2018. Results.— Seventy-six biopsies with an increased number of CaOx deposits were identified. CaOx deposits were counted on slides from the frozen tissue (MTM fixed or fresh frozen) and from the formalin-fixed cores. The density of CaOx deposits was significantly higher in formalin-fixed cores (13.6 ± 10.0/cm) than in MTM-fixed cores (3.2 ± 5.1/cm; P < .001). CaOx density in the kidney biopsy specimens decreased progressively with increased fixation time in MTM. No significant differences in the CaOx density between formalin-fixed and fresh frozen tissue were observed. Conclusions.— Our data demonstrate that fixation in MTM may result in a significant reduction in the number of CaOx deposits in a kidney biopsy specimen. This may make the diagnosis difficult, especially in small biopsy specimens with limited tissue in the formalin-fixed paraffin block.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».