Identification of Candidate Adaxial–Abaxial-Related Genes Regulating Petal Expansion During Flower Opening in Rosa chinensis “Old Blush”
Notice bibliographique
Résumé
Petal expansion is the main process by which flower opening occurs in roses (Rosa chinensis). While the regulation of leaf expansion has been extensively studied, little is known about the mechanisms controlling petal expansion. The regulation of leaf dorsoventral (adaxial–abaxial) polarity is important for blade expansion and morphogenesis, but the mechanisms involved adaxial-abaxial regulation in petals are unknown. We found that auxin, a key hormonal regulator of leaf adaxial–abaxial patterning, is unevenly distributed in rose petals. The transcriptomes of the adaxial and abaxial petal tissues were sequenced at three developmental stages during flower opening. Genes that were differentially expressed between the two tissues were filtered for those known to be involved in petal expansion and phytohormone biosynthesis, transport, and signaling, revealing potential roles in petal expansion, especially auxin pathway genes. Using a weighted gene coexpression network analysis (WGCNA), we identified two gene modules that may involve in adaxial–abaxial regulation, 21 and five hub genes have been found respectively. The qRT-PCR validation results were consistent with the RNA-seq data. Based on these findings, we propose a simple network of adaxial–abaxial related genes that regulates petal expansion in R. chinensis ‘Old Blush’. For the first time, we report the adaxial–abaxial transcriptional changes that occur during petal expansion, providing a reference for the study of the regulation of polarity in plant development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».