MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2967566622 · doi:10.3389/fpls.2019.01098

Identification of Candidate Adaxial–Abaxial-Related Genes Regulating Petal Expansion During Flower Opening in Rosa chinensis “Old Blush”

2019· article· en· W2967566622 sur OpenAlexfundno aff
Yu Han, Yong Xue, Jiayao Yu, Tangren Cheng, Jia Wang, Weiru Yang, Huitang Pan, Qixiang Zhang

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesChinese Academy of SciencesChina Postdoctoral Science FoundationInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPetalBiologyAuxinGeneArabidopsisTranscriptomeBotanyMorphogenesisRegulatorCell biologyGeneticsGene expressionMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Petal expansion is the main process by which flower opening occurs in roses (Rosa chinensis). While the regulation of leaf expansion has been extensively studied, little is known about the mechanisms controlling petal expansion. The regulation of leaf dorsoventral (adaxial–abaxial) polarity is important for blade expansion and morphogenesis, but the mechanisms involved adaxial-abaxial regulation in petals are unknown. We found that auxin, a key hormonal regulator of leaf adaxial–abaxial patterning, is unevenly distributed in rose petals. The transcriptomes of the adaxial and abaxial petal tissues were sequenced at three developmental stages during flower opening. Genes that were differentially expressed between the two tissues were filtered for those known to be involved in petal expansion and phytohormone biosynthesis, transport, and signaling, revealing potential roles in petal expansion, especially auxin pathway genes. Using a weighted gene coexpression network analysis (WGCNA), we identified two gene modules that may involve in adaxial–abaxial regulation, 21 and five hub genes have been found respectively. The qRT-PCR validation results were consistent with the RNA-seq data. Based on these findings, we propose a simple network of adaxial–abaxial related genes that regulates petal expansion in R. chinensis ‘Old Blush’. For the first time, we report the adaxial–abaxial transcriptional changes that occur during petal expansion, providing a reference for the study of the regulation of polarity in plant development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in Plant ScienceMême sujetPlant Molecular Biology ResearchTravaux en français237 207