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Enregistrement W2967589719 · doi:10.1139/cjm-2019-0153

Development and application of DNA-aptamer-coupled magnetic beads and aptasensors for the detection of <i>Cryptosporidium parvum</i> oocysts in drinking and recreational water resources

2019· article· en· W2967589719 sur OpenAlexafffundvenue
Asma Iqbal, Juewen Liu, Brent R. Dixon, Bahram Zargar, Syed A. Sattar

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasitic Infections and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of OttawaHealth CanadaUniversity of WaterlooAmerican Water (Canada)
Organismes subventionnairesOntario Water Consortium
Mots-clésCryptosporidium parvumAptamerCryptosporidiumBiotinylationBiosensorMonoclonal antibodyDetection limitMicrobiologyBiologyVirologyChemistryChromatographyMolecular biologyFecesAntibodyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Environmentally stable and disinfectant-resistant oocysts of Cryptosporidium spp. shed in the feces of infected humans and animals frequently contaminate water resources and are subsequently spread via potable and recreational waters. The current monoclonal-antibody-based methods for detecting them in water are slow, labor-intensive, and demand skills to interpret the results. We have developed DNA-aptamer-based aptasensors, coupled with magnetic beads, to detect and identify the oocysts of C. parvum for monitoring recreational and drinking water sources. A sensitive and specific electrochemical aptasensor (3′-biotinylated R4–6 aptamer) was used as a secondary ligand to bind the streptavidin-coated magnetic beads. This was incorporated into a probe using gold nanoparticle modified screen-printed carbon electrodes. Square wave voltammetry allowed for specific recognition of C. parvum oocysts. The aptamer-coated probes had an oocyst detection limit of 50. It did not bind to the cysts of Giardia duodenalis, another common waterborne pathogen, thus indicating its high specificity for the target pathogen. The system could successfully detect C. parvum oocysts in spiked samples of the raw lake and river waters. Therefore, the combined use of the aptasensor and magnetic beads has the potential to monitor water quality for C. parvum oocysts in field samples without relying on monoclonal antibodies and skill-demanding microscopy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,241
Score d'incertitude au seuil0,442

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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