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Enregistrement W2967758580 · doi:10.1101/19002345

Periodic Testing and Estimation of STD-HIV Association

2019· preprint· en· W2967758580 sur OpenAlexaff
Benoı̂t Mâsse, Pascal Guibord, Marie‐Claude Boily, Michel Alary

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversité LavalHôpital du Saint-Sacrement
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCovariateContext (archaeology)Proportional hazards modelStatisticsMedicineAssociation (psychology)Magnitude (astronomy)Human immunodeficiency virus (HIV)Hazard ratioEstimationDemographyEconometricsMathematicsConfidence intervalGeographyImmunologyPsychologyEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The validity of measures used in follow-up studies to estimate the magnitude of the HIV-STD association will be the focus of this paper. A recent simulation study by Boily et al [1] based on a model of HIV and STD transmission showed that the relative risk ( RR ), estimated by the hazard rate ratio ( HRR ) obtained by the Cox model had poor validity, either in absence or in presence of a real association between HIV and STD. The HRR tends to underestimate the true magnitude of a non-null association. These results were obtained from simulated follow-up studies where HIV was periodicaly tested every three months and every month for the STD. Aims and Methods This paper extends the above results by investigating the impact of using different periodic testing intervals on the validity of HRR estimates. Issues regarding the definition of exposure to STDs in this context are explored. A stochastic model for the transmission of HIV and other STDs is used to simulate follow-up studies with different periodic testing intervals. HRR estimates obtained with the Cox model with a time-dependent STD exposure covariate are compared to the true magnitude of the HIV-STD association. In addition, real data are reanalysed using the STD exposure definition described in this paper. The data from Laga et al [2] are used for this purpose. Results (1) Simulated data: independently of the magnitude of the true association, we observed a greater reduction of the bias when increasing the frequency of HIV testing than that of the STD testing. (2) Real data: The STD exposure definition can create substantial differences in the estimation of the HIV-STD association. Laga et al [2] have found a HRR of 2.5 (1.1 - 6.4) for the association between HIV and genital ulcer disease compared to an estimate of 3.5 (1.5 - 8.3) with our improved definition of exposure. Conclusions Results on the simulated data have an important impact on the design of field studies. For instance when choosing between two designs; one where both HIV and STD are screened every 3 months versus one where HIV and STD are screened every 3 months and monthly, respectively. The latter design is more expensive and involves more complicated logistics. Furthermore, this increment in cost may not be justified considering the relatively small gain in terms of validity and variability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,022
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,157
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,115

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0220,157
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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