Mapping quantitative trait loci associated with common bunt resistance in a spring wheat (Triticum aestivum L.) variety Lillian
Notice bibliographique
Résumé
Based on their consistency over environments, two QTL identified in Lillian on chromosomes 5A and 7A could be useful targets for marker assisted breeding of common bunt resistance. Common bunt of wheat ( Triticum aestivum L.) caused by Tilletia tritici and T. laevis is an economically important disease because of losses in grain yield and reduced grain quality. Resistance can be quantitative, under the control of multiple small effect genes. The Canada Western Red Spring wheat variety Lillian is moderately resistant to common bunt races found on the Canadian prairies. This study was conducted to identify and map quantitative trait loci (QTL) conferring resistance against common bunt in Lillian. A doubled haploid population comprising 280 lines was developed from F 1 plants of the cross of Lillian by Vesper. The lines were inoculated at seeding with the two races L16 ( T. laevis ) and T19 ( T. tritici ), grown in field near Swift Current, SK, in 2014, 2015 and 2016 and assessed for disease incidence. The lines were genotyped with the 90 K iSelect SNP genotyping assay, and a high-density genetic map was constructed. Quantitative trait locus analysis was performed with MapQTL.6 ® software. Two relatively stable common bunt resistance QTL, detected in two of the 3 years, were identified on chromosomes 5A and 7A from Lillian. In addition, three less stable QTL, appearing in one out of 3 years, were identified: one was contributed by Lillian on chromosome 3D and two were contributed by Vesper on chromosomes 1D and 2A. Epistatic interaction was identified for the bunt incidence between 3D and 7A resulting in greater bunt resistance. Future bunt resistance breeding will benefit from combining these QTL through gene pyramiding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».