MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2968620452 · doi:10.3389/fcimb.2019.00312

yqhG Contributes to Oxidative Stress Resistance and Virulence of Uropathogenic Escherichia coli and Identification of Other Genes Altering Expression of Type 1 Fimbriae

2019· article· en· W2968620452 sur OpenAlexafffund
Hicham Bessaiah, Pravil Pokharel, Hajer Habouria, Sébastien Houle, Charles M. Dozois

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular and Infection Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensCTT Group (Canada)Canadian Veterinary Medical AssociationInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésFimbriaPilusVirulenceBiologyMicrobiologyEscherichia coliFimbriae ProteinsTransposable elementMutantBacterial adhesinPhase variationGeneReporter geneGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Urinary tract infections (UTIs) are common bacterial infections and the vast majority of UTIs are caused by extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) strains referred to as uropathogenic E. coli (UPEC). For the successful colonization of the human urinary tract, UPEC employ a diverse collection of secreted or surface exposed virulence factors - toxins, iron acquisition systems, and adhesins such as type 1 fimbriae (pili). In order to identify factors involved in the expression of type 1 fimbriae, we constructed a chromosomal transcriptional reporter consisting of lux under the control of the fimbrial promoter region, fimS and this construct was inserted into the reference UPEC strain CFT073 genome at the attTn7 site. This fimS reporter strain was used to generate a Tn10 transposon mutant library, coupled with high-throughput sequencing to identify genes that affect the expression of type 1 fimbriae. Transposon insertion sites were linked to genes involved in protein fate and synthesis, energy metabolism, adherence, transcriptional regulation, and transport. We showed that YqhG, a predicted periplasmic protein, is one of the important mediators that contribute to the decreased expression of type 1 fimbriae in UPEC strain CFT073. The ΔyqhG mutant had reduced expression of type 1 fimbriae and a decreased capacity to colonize the murine urinary tract. Reduced expression of type 1 fimbriae correlated with an increased bias for orientation of the fim switch in the OFF position. Interestingly, the ΔyqhG mutant was more motile than the WT strain and was also significantly more sensitive to hydrogen peroxide. Taken together, loss of yqhG may decrease virulence in the urinary tract due to a decrease in production of type 1 fimbriae and a greater sensitivity to oxidative stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,174
Score d'incertitude au seuil0,327

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in Cellular and Infection MicrobiologyMême sujetEscherichia coli research studiesTravaux en français237 207