OTHR-09. IDENTIFYING EPIGENETIC SIGNATURES IN LUNG ADENOCARCINOMAS THAT PREDICT DEVELOPMENT OF BRAIN METASTASIS
Notice bibliographique
Résumé
Abstract INTRODUCTION: Metastases are the most common adult brain tumor with half spreading from lung cancers and they reduce median overall survival from 26 to 12 months. There are no robust patient-specific predictors of brain metastasis. Epigenetic signatures predict disease recurrence in other cancers and identifying brain metastasis methylation-based signatures may allow for treatment approaches to high-risk patients that prevent their development. METHODS: In 207 lung adenocarcinomas, multivariate cox time to brain metastasis analyses including clinically-relevant variables (lung tumor size and TNM nodal score) along with significant covariates on univariate analyses were performed. DNA was extracted from 142 of these tumors and profiled on the Illumina Infinium EPIC array. A generalized boosted regression classification model used differentially methylated CpG sites significantly predicting time to brain metastasis in a 70% training cohort cox analysis (p< 0.05). Resulting methylation-based risk scores were compared to size and nodal status in a multivariate analysis of the independent 30% testing cohort. RESULTS: Of 207 patients with 72 brain metastatic events, tumor size (HR=1.5, 95%CI 1.1–2.0, p=0.01), N status (N3 vs. N0, HR=9.9, 95%CI 3.1–31, p=0.0001), EGFR status (HR=0.4, 95%CI 0.2–0.8, p=0.014), and age (HR=0.7, 95%CI 0.5–1.0, p=0.039) independently predicted their development. Methylation-based risk scores significantly predicted time to brain metastasis in a univariate analysis of the testing cohort (p=0.03). A multivariate analysis of testing cohort patients identified methylation score as the only independent predictor of brain metastasis (HR=4.3, 95%CI 1.1–17, p=0.038) accounting for tumor size and N score. CONCLUSIONS: Genome-wide DNA methylation signatures predict brain metastasis development in lung adenocarcinomas independent of tumor size and nodal disease. The design of a nomogram combining methylation profile other clinical factors may be used to determine patient specific brain metastasis risk values to guide patient counselling, extent of treatment, and screening.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».