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Enregistrement W2968897879 · doi:10.3389/fpls.2019.01105

The C-Terminal Domains SnRK2 Box and ABA Box Have a Role in Sugarcane SnRK2s Auto-Activation and Activity

2019· article· en· W2968897879 sur OpenAlexafffund
Germanna Lima Righetto, Dev Sriranganadane, Levon Halabelian, Carla G. Chiodi, Jonathan M. Elkins, Katlin B. Massirer, O. Gileadi, Marcelo Menossi, Rafael M. Couñago

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensStructural Genomics Consortium
Organismes subventionnairesOffice of ScienceMinistero dello Sviluppo EconomicoUniversidade Estadual de CampinasConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoOntario Ministry of Economic Development and InnovationWellcome TrustNovartis PharmaCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloGenome CanadaPfizerEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaAArgonne National LaboratoryU.S. Department of Energy
Mots-clésProtein kinase AAbscisic acidAutophosphorylationAbiotic stressCell biologyKinaseBiologyArabidopsis thalianaMAP2K7BiochemistryCyclin-dependent kinase 2Mutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Resistance to drought stress is fundamental to plant survival and development. Abscisic acid (ABA) is one of the major hormones involved in different types of abiotic and biotic stress responses. ABA intracellular signaling has been extensively explored in Arabidopsis thaliana and occurs via a phosphorylation cascade mediated by three related protein kinases, denominated SnRK2s (SNF1-related protein kinases). However, the role of ABA signaling and the biochemistry of SnRK2 in crop plants remains underexplored. Considering the importance of the ABA hormone in abiotic stress tolerance, here we investigated the regulatory mechanism of sugarcane SnRK2s - known as SAPKs (Stress/ABA-activated Protein Kinases). The crystal structure of ScSAPK10 revealed the characteristic SnRK2 family architecture, in which the regulatory SnRK2-box interacts with the kinase domain αC helix. To study sugarcane SnRK2 regulation, we produced a series of mutants for the protein regulatory domains SnRK2-box and ABA-box. Mutations in ScSAPK8 SnRK2-box aimed at perturbing its interaction with the protein kinase domain reduced protein kinase activity in vitro. On the other hand, mutations to ScSAPK ABA-box did not impact protein kinase activity but did alter the protein autophosphorylation pattern. Taken together, our results demonstrate that both SnRK2- and ABA-boxes might play a role in sugarcane SnRK2 function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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