Type 8 long QT syndrome: pathogenic variants in CACNA1C-encoded Cav1.2 cluster in STAC protein binding site
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: Pathogenic gain-of-function variants in CACAN1C cause type-8 long QT syndrome (LQT8). We sought to describe the electrocardiographic features in LQT8 and utilize molecular modelling to gain mechanistic insights into its genetic culprits. METHODS AND RESULTS: Rare variants in CACNA1C were identified from genetic testing laboratories. Treating physicians provided clinical information. Variant pathogenicity was independently assessed according to recent guidelines. Pathogenic (P) and likely pathogenic (LP) variants were mapped onto a 3D modelled structure of the Cav1.2 protein. Nine P/LP variants, identified in 23 patients from 19 families with non-syndromic LQTS were identified. Six variants, found in 79% of families, clustered to a 4-residue section in the cytosolic II-III loop region which forms a region capable of binding STAC SH3 domains. Therefore, variants may affect binding of SH3-domain containing proteins. Arrhythmic events occurred in similar proportions of patients with II-III loop variants and with other P/LP variants (53% vs. 48%, P = 0.41) despite shorter QTc intervals (477 ± 31 ms vs. 515 ± 37 ms, P = 0.03). A history of sudden death was reported only in families with II-III loop variants (60% vs. 0%, P = 0.03). The predominant T-wave morphology was a late peaking T wave with a steep descending limb. Exercise testing demonstrated QTc prolongation on standing and at 4 min recovery after exercise. CONCLUSION: The majority of P/LP variants in patients with CACNA1C-mediated LQT8 cluster in an SH3-binding domain of the cytosolic II-III loop. This represents a 'mutation hotspot' in LQT8. A late-peaking T wave with a steep descending limb and QT prolongation on exercise are commonly seen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».