Evaluation of antagonistic activities against Pythium myriotylum and plant growth promoting traits of Streptomyces isolated from Cocoyam (Xanthosoma sagittifolium (L.) Schott) rhizosphere
Notice bibliographique
Résumé
The focus of this study was to isolate, evaluate and characterize cocoyam rhizospheric actinobacteria collected from Mount Cameroon for their potential antagonistic activities against Pythium myriotylum, the causative agent of cocoyam root rot disease, and/or their ability to promote plant growth. Actinobacteria were isolated from soil samples by using serial dilution method. Dual culture assay was used to screen the isolates against fungal phytopathogens including P. myriotylum. The selected isolates were characterized morphologically, physiologically, biochemically and genetically. Furthermore, these isolates were subjected to in vitro production of various plant growth promoting (PGP) traits. Among the 287 isolates distributed into 12 distinct groups, PFK4, PFBOT7 and PFEL2 had high antagonistic effects against P. myriotylum and they were regarded as promising candidates for further study of their biocontrol ability. The identification of actinobacterial isolates was done using universal PCR of partial 16S rRNA sequences combined with bioinformatics and phylogenetic procedures. The results revealed that all these isolates belong to the genus Streptomyces spp. The isolate PFK4 showed 99% similarity with Streptomyces albulus while PFBOT7 showed 99% similarity with Streptomyces albus and PFEL2 showed 98% similarity with Streptomyces gandoceansis based on their 16S rRNA gene sequences. In this study for the first time, we report S. gandocaensis strain for the biological control of Pythium myriotylum. The role of these isolates in Plant Growth Promotion (PGP) by in vitro production of PGP traits such as phosphate solubilisation, siderophore, indole-3-acetic acid (IAA), ACC deaminase and cell wall degrading enzymes production were also evaluated and showed as potential PGP agents. Concurrent production of PGP substances coupled with broad spectrum of antifungal and antibacterial activities of these three strains suggest their potential use as promising biocontrol and PGP tools for the development of an alternative control method for cocoyam cultivation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».