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Enregistrement W2969225945 · doi:10.1002/pld3.163

Si permeability of a deficient Lsi1 aquaporin in tobacco can be enhanced through a conserved residue substitution

2019· article· en· W2969225945 sur OpenAlexafffund
Devrim Coskun, Rupesh Deshmukh, Humira Sonah, S. M. Shivaraj, Rachelle Frenette‐Cotton, Laurence Tremblay, Paul Isenring

Notice bibliographique

RevuePlant Direct · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSilicon Effects in Agriculture
Établissements canadiensHôtel-Dieu de QuébecUniversité Laval
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésResidue (chemistry)ChemistrySubstitution (logic)AquaporinPermeability (electromagnetism)BiophysicsBiochemistryBiologyMembraneComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Silicon (Si) is a beneficial substrate for many plants, conferring heightened resilience to environmental stress. A plant's ability to absorb Si is primarily dependent on the presence of a Si‐permeable Lsi1 (NIP2‐1) aquaporin in its roots. Structure‐function analyses of Lsi1 channels from higher plants have thus far revealed two key molecular determinants of Si permeability: (a) the amino acid motif GSGR in the aromatic/arginine selectivity filter and (b) 108 amino acids between two highly conserved NPA domains. Curiously, tobacco ( Nicotiana sylvestris ) stands as a rare exception as it possesses an Lsi1 (NsLsi1) with these molecular signatures but is reported as a low Si accumulator. The aim of this study was therefore to identify whether additional determinants influence Si permeability via Lsi1 channels, focusing on the role of residues that differ uniquely in NsLsi1 relative to functional Lsi1 homologs. We observed tobacco indeed absorbed Si poorly (0.1% dw), despite NsLsi1 being expressed constitutively in planta . Si influx measured in NsLsi1‐expressing Xenopus oocytes was very low (<13% that of OsLsi1 from rice ( Oryza sativa ) over a 3‐hr time course), which likely explains why tobacco is a low Si accumulator. Interestingly, NsLsi1 P125F displayed a significant gain of function (threefold increase in Si influx relative to NsLsi1 WT ), which coincided with a threefold increase in plasma membrane localization in planta , as measured by transient expression of GFP constructs in Nicotiana benthamiana leaves. These findings thus reveal a novel molecular determinant of Si transport in plants and inform breeding, biotechnological, and agricultural practices to effectively utilize Si in the context of plant resilience to environmental stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,496
Score d'incertitude au seuil0,929

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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