A14 Estimating time since HIV infection using next-generation sequencing data: A unique tool to help understand HIV prevention among high-risk young women in Ukraine
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The transitions study examines HIV risk among adolescent girls and young women through their sexual life course from first sex, to past and current engagement in casual sex, transactional sex, and, for some, formal sex work (FSW). Understanding the timing of HIV infection and the circumstances around early infection in young females is critical to HIV prevention interventions. We inferred time since HIV infection using next-generation sequencing (NGS) of the HIV pol gene isolated from cross-sectional samples among high-risk young women in Dnipro, Ukraine. Dried blood spots were collected on Whatman 903 cards from young women aged 14–24 engaged in casual sex (n = 894), transactional sex (n = 464), and FSW (n = 452). The HIV pol gene was sequenced using an in-house NGS HIV drug resistance mutation genotyping assay. Time since HIV infection was inferred using an online tool as described by Puller et al. (2017) freely available at https://hiv.biozentrum.unibas.ch/ETI/. The mean estimated time since HIV infection (ETI) for participants engaged in casual sex, transactional sex, and FSW is 1.98, 1.84, and 3.01 years, respectively. ETI was used to determine the duration of HIV infection for each participant and compared to the number of sexually active years prior to FSW. Among FSW, 61 per cent of participants were infected with HIV prior to entry into sex work. In general, ETI from NGS data suggests that FSWs were infected with HIV before entry into FSW. Expansion of targeted prevention programs beyond FSW could play an important role in mitigating HIV transmission at the population level.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle