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Enregistrement W2969414401 · doi:10.14785/lymphosign-2019-0010

Novel heterozygous <i>NFKB1</i> mutation—variable penetrance in a family cohort

2019· article· en· W2969414401 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCommon variable immunodeficiencyFrameshift mutationPenetranceMutationGeneticsBiologyLoss functionPhenotypeVariable ExpressionGeneAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Common variable immunodeficiency (CVID) is a term used to define a heterogeneous group of patients who commonly have hypogammaglobulinemia and variable degrees of modest T cell dysfunction. Recent advances made in next generation sequencing technologies have accelerated the identification of CVID disease-causing genes, including NFKB1, a component of the nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated B cells (NF-κB) pathway. Objective: We sought to identify the genetic defect in a 3-generation family of patients with CVID who presented with cytopenias, eczema, and recurrent sinopulmonary infections. Methods: Whole exome sequencing and Sanger confirmation was performed, and a combination of molecular and cellular techniques used to assess the variant impact on B and T cell function. Results: A novel heterozygous frameshift mutation in NFKB1, encoding the transcriptional regulator protein p50/p105, was identified. This resulted in c.1584dupG (p.M528fs). We demonstrate that c.1584dupG is a loss-of-function variant, responsible for reduced p105/p50 protein expression in affected individuals as well as variable increased CD21 low B cell numbers. Conclusion: This novel mutation affecting NFKB1 causes a CVID phenotype with variable clinical manifestations. Given the wide spectrum of age in this kindred, this may reflect diversity of phenotype expression, or more probably, age-related expression of typical features. Statement of novelty: We report here a novel loss-of-function frameshift mutation in NFKB1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,902
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle