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Enregistrement W2969440303 · doi:10.1038/s41598-019-48226-w

Specimen Collection for Translational Studies in Hidradenitis Suppurativa

2019· article· en· W2969440303 sur OpenAlexafffund
Angel S. Byrd, Yemisi Dina, U. J. Okoh, Q. Q. Quartey, Carmelo Carmona‐Rivera, Dionna W. Williams, Michelle L. Kerns, Robert J. Miller, Lynn Petukhova, Haley B. Naik, Leandra A. Barnes, William Shipman, Julie Caffrey, Justin M. Sacks, Stephen M. Milner, Oluseyi Aliu, Kristen P. Broderick, D. Kim, H. Liu, Carly Dillen, Richard Ahn, John W. Frew, Mariana J. Kaplan, Sewon Kang, Luis A. Garza, Lloyd Miller, Afsáneh Alavi, Michelle A. Lowes, Ginette A. Okoye

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHidradenitis Suppurativa and Treatments
Établissements canadiensWomen's College HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesIrving Medical Center, Columbia UniversityNational Institutes of HealthValeant Pharmaceuticals InternationalAndrew W. Mellon FoundationJohns Hopkins UniversityAmerican Academy of Dermatology
Mots-clésBiobankHidradenitis suppurativaMedicineIntertriginousTranslational researchDiseasePopulationDemographicsMultidisciplinary approachBioinformaticsPathologyBiologyEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hidradenitis suppurativa (HS) is a chronic inflammatory disorder characterized by painful nodules, sinus tracts, and scars occurring predominantly in intertriginous regions. The prevalence of HS is currently 0.053-4%, with a predominance in African-American women and has been linked to low socioeconomic status. The majority of the reported literature is retrospective, population based, epidemiologic studies. In this regard, there is a need to establish a repository of biospecimens, which represent appropriate gender and racial demographics amongst HS patients. These efforts will diminish knowledge gaps in understanding the disease pathophysiology. Hence, we sought to outline a step-by-step protocol detailing how we established our HS biobank to facilitate the formation of other HS tissue banks. Equipping researchers with carefully detailed processes for collection of HS specimens would accelerate the accumulation of well-organized human biological material. Over time, the scientific community will have access to a broad range of HS tissue biospecimens, ultimately leading to more rigorous basic and translational research. Moreover, an improved understanding of the pathophysiology is necessary for the discovery of novel therapies for this debilitating disease. We aim to provide high impact translational research methodology for cutaneous biology research and foster multidisciplinary collaboration and advancement of our understanding of cutaneous diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,049
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,026
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,259

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0490,026
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0050,003
Communication savante0,0050,002
Science ouverte0,0040,005
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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