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Enregistrement W2969639913 · doi:10.1371/journal.ppat.1007991

Latency reversal agents affect differently the latent reservoir present in distinct CD4+ T subpopulations

2019· article· en· W2969639913 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesInstituto de Salud Carlos IIIAgència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de RecercaNational Institutes of HealthMinisterio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de EspañaGilead SciencesBristol-Myers Squibb CanadaBristol-Myers Squibb
Mots-clésBiologyRNAVirologyPanobinostatImmunologyVirus latencyVirusGeneticsGeneViral replication

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Latency reversal agents (LRAs) have proven to induce HIV-1 transcription in vivo but are ineffective at decreasing the size of the latent reservoir in antiretroviral treated patients. The capacity of the LRAs to perturb the viral reservoir present in distinct subpopulations of cells is currently unknown. Here, using a new RNA FISH/flow ex vivo viral reactivation assay, we performed a comprehensive assessment of the viral reactivation capacity of different families of LRAs, and their combinations, in different CD4+ T cell subsets. We observed that a median of 16.28% of the whole HIV-reservoir induced HIV-1 transcripts after viral reactivation, but only 10.10% of these HIV-1 RNA+ cells produced the viral protein p24. Moreover, none of the LRAs were powerful enough to reactivate HIV-1 transcription in all CD4+ T cell subpopulations. For instance, the combination of Romidepsin and Ingenol was identified as the best combination of drugs at increasing the proportion of HIV-1 RNA+ cells, in most, but not all, CD4+ T cell subsets. Importantly, memory stem cells were identified as highly resistant to HIV-1 reactivation, and only the combination of Panobinostat and Bryostatin-1 significantly increased the number of cells transcribing HIV within this subset. Overall, our results validate the use of the RNA FISH/flow technique to assess the potency of LRAs among different CD4+ T cell subsets, manifest the intrinsic differences between cells that encompass the latent HIV reservoir, and highlight the difficulty to significantly impact the latent infection with the currently available drugs. Thus, our results have important implications for the rational design of therapies aimed at reversing HIV latency from diverse cellular reservoirs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle