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Enregistrement W2969651774 · doi:10.1074/jbc.ra119.008047

Arabidopsis CTP:phosphocholine cytidylyltransferase 1 is phosphorylated and inhibited by sucrose nonfermenting 1–related protein kinase 1 (SnRK1)

2019· article· en· W2969651774 sur OpenAlexafffund
Kristian Mark P. Caldo, Yang Xu, Lucas J. Falarz, Kethmi N. Jayawardhane, Jeella Z. Acedo, Guanqun Chen

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsGovernment of CanadaAlberta InnovatesAlberta Agriculture and Forestry
Mots-clésPhosphorylationNicotiana benthamianaPhosphocholineProtein kinase ABiochemistryCell biologyBiologyKinaseArabidopsisChemistryMutantPhosphatidylcholineGenePhospholipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

De novo phosphatidylcholine (PC) biosynthesis via the Kennedy pathway involves highly endergonic biochemical reactions that must be fine-tuned with energy homeostasis. Previous studies have shown that CTP:phosphocholine cytidylyltransferase (CCT) is an important regulatory enzyme in this pathway and that its activity can be controlled at both transcriptional and posttranslational levels. Here we identified an important additional mechanism regulating plant CCT1 activity. Comparative analysis revealed that Arabidopsis CCT1 (AtCCT1) contains catalytic and membrane-binding domains that are homologous to those of rat CCT1. In contrast, the C-terminal phosphorylation domain important for stringent regulation of rat CCT1 was apparently missing in AtCCT1. Instead, we found that AtCCT1 contains a putative consensus site (Ser-187) for modification by sucrose nonfermenting 1–related protein kinase 1 (SnRK1 or KIN10/SnRK1.1), involved in energy homeostasis. Phos-tag SDS-PAGE coupled with MS analysis disclosed that SnRK1 indeed phosphorylates AtCCT1 at Ser-187, and we found that AtCCT1 phosphorylation substantially reduces its activity by as much as 70%. An S187A variant exhibited decreased activity, indicating the importance of Ser-187 in catalysis, and this variant was less susceptible to SnRK1-mediated inhibition. Protein truncation and liposome binding studies indicated that SnRK1-mediated AtCCT1 phosphorylation directly affects the catalytic domain rather than interfering with phosphatidate-mediated AtCCT1 activation. Overexpression of the AtCCT1 catalytic domain in Nicotiana benthamiana leaves increased PC content, and SnRK1 co-expression reduced this effect. Taken together, our results suggest that SnRK1 mediates the phosphorylation and concomitant inhibition of AtCCT1, revealing an additional mode of regulation for this key enzyme in plant PC biosynthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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