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Enregistrement W2969716024 · doi:10.11575/prism/36663

Developing an in Vivo Reporter System for Murine CXCL1 Gene Expression, and Studying the Consequences of STING Activation on T Lymphocytes.

2019· dissertation· en· W2969716024 sur OpenAlexfundno aff
Oksana Yavorska

Notice bibliographique

RevuePRISM (University of Calgary) · 2019
Typedissertation
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésStingIn vivoCXCL1Gene expressionReporter geneBiologyCell biologyGeneComputational biologyImmunologyMolecular biologyChemokineGeneticsImmune systemEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our lab generated CXCL1-Luc2-RFP reporter mouse and its K-rasLA1/+ cross to provide the means for BLI and intravital imaging of spontaneously arising K-ras driven lung tumours, using a transgenic animal model that closely recapitulates human lung tumourigenesis. CXCL1 (KC) chemokine promoter carried by a bacterial artificial chromosome (BAC) was hijacked so as to express reporter proteins, luciferase-2 and RFP, within tumours where oncogenic K-ras is known to drive CXCL1 expression. During this study, we established that CXCL1-Luc2-RFP x K-rasLA1/+ cross does not generate bioluminescence signal, while CXCL1-Luc2-RFP mouse strain is a functional reporter of CXCL1 expression in acute inflammation models. Next, for targeting lung and other cancers, our lab has been studying the activation of Stimulator of interferon genes (STING) as an immunotherapeutic approach. While the direct effects of STING activation have been extensively characterised in antigen presenting cells (APCs), they have not been thoroughly investigated in T cells. We found that in contrast to positive regulation of APCs, stimulation of STING induced T cell apoptosis, which was independent of T cell activation status and potential autocrine type I interferon (IFN) signalling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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