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Enregistrement W2969801331 · doi:10.1093/jac/dkz283

42936 pathogens from Canadian hospitals: 10 years of results (2007–16) from the CANWARD surveillance study

2019· article· en· W2969801331 sur OpenAlexafffundabout
George G. Zhanel, Heather J. Adam, Melanie Baxter, Jeff Fuller, Kimberly A. Nichol, Andrew Denisuik, Alyssa Golden, Rachel Hink, Philippe Lagacé‐Wiens, Andrew Walkty, Michael R. Mulvey, Frank Schweizer, Denice C. Bay, Daryl J. Hoban, James A. Karlowsky, Joseph M. Blondeau, Robert Slinger, Ross Davidson, D. J. Hoban, J Delport, Chelsey Ellis, Michél Laverdière, Vivian G. Loo, Susan M. Poutanen, J Fuller, D. Roscoe, Marc Desjardins, Larissa Matukas, M Goyette, C Lee, Alex Carignan, Marco Bergevin, Romain Pelletier

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaSt. Boniface HospitalLondon Health Sciences CentreWestern UniversityUniversity of ManitobaVictoria HospitalHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesAchaogenMedicines CompanyZoetisPublic Health Agency of CanadaDiagnostic Services ManitobaSunovionBayerUniversity of ManitobaAstraZenecaAstellas Pharma USPfizerMerckAbbott Laboratories
Mots-clésTigecyclineMedicineColistinBroth microdilutionLinezolidAmikacinMeropenemErtapenemAntimicrobialTazobactamMethicillin-resistant Staphylococcus aureusMicrobiologyPseudomonas aeruginosaVancomycinInternal medicineStaphylococcus aureusAntibioticsAntibiotic resistanceImipenemBiologyMinimum inhibitory concentration

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: The CANWARD surveillance study was established in 2007 to annually assess the in vitro susceptibilities of a variety of antimicrobial agents against bacterial pathogens isolated from patients receiving care in Canadian hospitals. METHODS: 42 936 pathogens were received and CLSI broth microdilution testing was performed on 37 355 bacterial isolates. Limited patient demographic data submitted with each isolate were collated and analysed. RESULTS: Of the isolates tested, 43.5%, 33.1%, 13.2% and 10.2% were from blood, respiratory, urine and wound specimens, respectively; 29.9%, 24.8%, 19.0%, 18.1% and 8.2% of isolates were from patients in medical wards, emergency rooms, ICUs, hospital clinics and surgical wards. Patient demographics associated with the isolates were: 54.6% male/45.4% female; 13.1% patients aged ≤17 years, 44.3% 18-64 years and 42.7% ≥65 years. The three most common pathogens were Staphylococcus aureus (21.2%, both methicillin-susceptible and MRSA), Escherichia coli (19.6%) and Pseudomonas aeruginosa (9.0%). E. coli were most susceptible to meropenem and tigecycline (99.9%), ertapenem and colistin (99.8%), amikacin (99.7%) and ceftolozane/tazobactam and plazomicin (99.6%). Twenty-three percent of S. aureus were MRSA. MRSA were most susceptible to ceftobiprole, linezolid and telavancin (100%), daptomycin (99.9%), vancomycin (99.8%) and tigecycline (99.2%). P. aeruginosa were most susceptible to ceftolozane/tazobactam (98.3%) and colistin (95.0%). CONCLUSIONS: The CANWARD surveillance study has provided 10 years of reference antimicrobial susceptibility testing data on pathogens commonly causing infections in patients attending Canadian hospitals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,552
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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