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Enregistrement W2969856544 · doi:10.1007/s00401-019-02062-4

Epigenetic loss of RNA-methyltransferase NSUN5 in glioma targets ribosomes to drive a stress adaptive translational program

2019· article· en· W2969856544 sur OpenAlex
Maxime Janin, Vanessa Ortiz-Barahona, Manuel Castro de Moura, Anna Martínez‐Cardús, Pere Llinàs‐Arias, Marta Soler, Daphna Nachmani, Joffrey Pelletier, Ulrike Schümann, María Eréndira Calleja-Cervantes, Sebastián Morán, Sònia Guil, Alberto Bueno-Costa, David Piñeyro, Montserrat Pérez-Salvia, Margalida Rosselló-Tortella, Laia Piqué, Joan Josep Bech‐Serra, Carolina de la Torre, August Vidal, María Martínez‐Iniesta, Juan F. Martín-Tejera, Alberto Villanueva, Alexandra Arias, Isabel Cuartas, Ana M. Aransay, Andrés Morales La Madrid, Ángel M. Carcaboso, Vicente Santa‐María, Jaume Mora, Agustín F. Fernández, Mario F. Fraga, Ibán Aldecoa, Leire Pedrosa, Francesc Graus, Noemí Vidal, Fina Martínez‐Soler, Avelina Tortosa, Cristina Carrato, Carmen Balañá, Matthew W. Boudreau, Paul J. Hergenrother, Peter Kötter, Karl-Dieter Entian, Jürgen Hench, Stephan Frank, Sheila Mansouri, Gelareh Zadeh, Pablo D. Dans, Modesto Orozco, George Thomas, Sandra Blanco, Joan Seoane, Thomas Preiß, Pier Paolo Pandolfi, Manel Esteller

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueActa Neuropathologica · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensToronto Western HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesInstituto de Salud Carlos IIIXarxa de Bancs de Tumors de CatalunyaMinisterio de Economía y CompetitividadGeneralitat de CatalunyaAustralian Cancer Research FoundationCentres de Recerca de Catalunya
Mots-clésEpigeneticsMethyltransferaseBiologyGliomaRNAMethylationTranscriptomeGene silencingTranslation (biology)RNA silencingDNA methylationStress granuleRibosomeCell biologyCancer researchGeneticsMessenger RNARNA interferenceDNAGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tumors have aberrant proteomes that often do not match their corresponding transcriptome profiles. One possible cause of this discrepancy is the existence of aberrant RNA modification landscapes in the so-called epitranscriptome. Here, we report that human glioma cells undergo DNA methylation-associated epigenetic silencing of NSUN5, a candidate RNA methyltransferase for 5-methylcytosine. In this setting, NSUN5 exhibits tumor-suppressor characteristics in vivo glioma models. We also found that NSUN5 loss generates an unmethylated status at the C3782 position of 28S rRNA that drives an overall depletion of protein synthesis, and leads to the emergence of an adaptive translational program for survival under conditions of cellular stress. Interestingly, NSUN5 epigenetic inactivation also renders these gliomas sensitive to bioactivatable substrates of the stress-related enzyme NQO1. Most importantly, NSUN5 epigenetic inactivation is a hallmark of glioma patients with long-term survival for this otherwise devastating disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,346
Score d'incertitude au seuil0,610

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle