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Enregistrement W2969862350 · doi:10.31117/neuroscirn.v2i3.30

Chemical hypoxia in human pluripotent NT2 stem cell-derived neurons: Effect of hydroxamic acid and benzamide-based epigenetic drugs

2019· article· en· W2969862350 sur OpenAlexaff
Rushita A. Bagchi, Ashim K. Bagchi, Ankita Salunke, Dipak K Hens, Pragna Parikh

Notice bibliographique

RevueNeuroscience Research Notes · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensSt. Boniface Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHistone deacetylaseHypoxia (environmental)Induced pluripotent stem cellApoptosisCell biologyOxidative stressHistone deacetylase inhibitorProgrammed cell deathPharmacologyChemistryBiologyHistoneBiochemistryEmbryonic stem cellOxygen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypoxia-induced oxidative stress contributes to neuronal damage leading to many neurodegenerative disorders. Hypoxia promotes many downstream effectors such as hypoxia-inducible factor-1α (HIF-1α) in order to restore respiratory homeostasis due to low oxygen availability and increased ROS. Use of histone deacetylase (HDAC) inhibitors may modulate hypoxia-induced neuronal cell damage. In this study, we used two chemically diverse HDAC inhibitors to investigate their effect on hypoxia-exposed neuronal cells. Human pluripotent NT-2 stem cell-derived neuronal differentiated cells were exposed to CoCl2 pre-treatment for 6h to induce hypoxia, prior to supplementation of HDAC inhibitor (SAHA or MGCD0103). Treatment with HDAC inhibitor improved cell viability in hypoxia-induced neuronal cells. The increased HIF1α expression in hypoxia-induced neuronal cells was blunted by these HDAC inhibitors with a concomitant decrease in ROS production. CoCl2 treatment caused an increase in IL-1β, which was significantly inhibited by these HDAC inhibitors. Furthermore, apoptosis induced in these CoCl2 treated neuronal cells was mitigated by SAHA as well MGCD0103 suggesting that these HDAC inhibitors are capable of reducing cellular toxicity, inflammation and apoptosis, and thus, could be beneficial as therapeutic molecules for many neuropathological conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,776

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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