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Enregistrement W2969964860 · doi:10.1136/bmjopen-2019-032334

Clinical trial data sharing: here’s the challenge

2019· article· en· W2969964860 sur OpenAlexaff
Sonali Kochhar, Bartha Maria Knoppers, Carrol Gamble, Alan Chant, Jeffrey P. Koplan, Georgina Humphreys

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueData Analysis and Archiving
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésData sharingMedicineWork (physics)Promotion (chess)Data managementResource (disambiguation)Data accessClinical trialHealth careData collectionData scienceKnowledge managementPublic relationsAlternative medicineComputer scienceData mining

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Anonymised patient-level data from clinical research are increasingly recognised as a fundamental and valuable resource. It has value beyond the original research project and can help drive scientific research and innovations and improve patient care. To support responsible data sharing, we need to develop systems that work for all stakeholders. The members of the Independent Review Panel (IRP) for the data sharing platform Clinical Study Data Request (CSDR) describe here some summary metrics from the platform and challenge the research community on why the promised demand for data has not been observed. SUMMARY OF DATA: From 2014 to the end of January 2019, there were a total of 473 research proposals (RPs) submitted to CSDR. Of these, 364 met initial administrative and data availability checks, and the IRP approved 291. Of the 90 research teams that had completed their analyses by January 2018, 41 reported at least one resulting publication to CSDR. Less than half of the studies ever listed on CSDR have been requested. CONCLUSION: While acknowledging there are areas for improvement in speed of access and promotion of the platform, the total number of applications for access and the resulting publications have been low and challenge the sustainability of this model. What are the barriers for data contributors and secondary analysis researchers? If this model does not work for all, what needs to be changed? One thing is clear: that data access can realise new and unforeseen contributions to knowledge and improve patient health, but this will not be achieved unless we build sustainable models together that work for all.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,649
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,819
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,988
Score d'incertitude au seuil0,433

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,6490,819
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,008
Bibliométrie0,0070,012
Études des sciences et des technologies0,0070,033
Communication savante0,0330,057
Science ouverte0,0120,027
Intégrité de la recherche0,0190,029
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0220,015

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,600
Tête enseignante GPT0,588
Écart entre enseignants0,012 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
DomaineReproductibilité
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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