Coordinated cellular neighborhoods orchestrate antitumoral immunity at the colorectal cancer invasive front
Notice bibliographique
Résumé
SUMMARY Antitumoral immunity requires organized, spatially nuanced interactions between components of the immune tumor microenvironment (iTME). Understanding this coordinated behavior in effective versus ineffective tumor control will advance immunotherapies. We optimized CO-Detection by indEXing (CODEX) for para ffin-em bedded tissue microarrays, enabling profiling of 140 tissue regions from 35 advanced-stage colorectal cancer (CRC) patients with 56 protein markers simultaneously. We identified nine conserved, distinct cellular neighborhoods (CNs)–a collection of components characteristic of the CRC iTME. Enrichment of PD-1 + CD4 + T cells only within a granulocyte CN positively correlated with survival in a high-risk patient subset. Coupling of tumor and immune CNs, fragmentation of T cell and macrophage CNs, and disruption of inter-CN communication was associated with inferior outcomes. This study provides a framework for interrogating complex biological processes, such as antitumoral immunity, demonstrating an example of how tumors can disrupt imm une functionality through interference in the concerted action of cells and spatial domains.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».