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Enregistrement W2970017451 · doi:10.1186/s13041-019-0493-9

SUMOylation regulates USP5-Cav3.2 calcium channel interactions

2019· article· en· W2970017451 sur OpenAlexafffund
Agustı́n Garcı́a-Caballero, Fang‐Xiong Zhang, Lina Chen, Saïd M’Dahoma, Junting Huang, Gerald W. Zamponi

Notice bibliographique

RevueMolecular Brain · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesInstitute of Neurosciences, Mental Health and AddictionCanadian Institutes of Health ResearchAlberta InnovatesCanada Research Chairs
Mots-clésSUMO proteinCalcium channelNeuroscienceCell biologyBiologyChemistryCalciumUbiquitinGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cav3.2 calcium channels play a key role in nociceptive signaling in the primary afferent pain pathway. We have previously reported the regulation of Cav3.2 calcium channels by the deubiquitinase USP5 and its importance for regulating peripheral transmission of pain signals. Here we describe the regulation of the Cav3.2-USP5 interaction by SUMOylation. We show that endogenous USP5 protein expressed in dorsal root ganglia undergoes SUMOylation, and the level of USP5 SUMOylation is reduced following peripheral nerve injury. SUMO prediction software identified several putative lysines that have the propensity to be targets for SUMO conjugation. A series of single lysine substitutions in an mCherry tagged USP5 construct followed by expression in tsA-201 cells identified lysine K113 as a key target for USP5 SUMO2/3 modification. Finally, Cav3.2 calcium channel immunoprecipitates revealed a stronger interaction of Cav3.2 with a SUMO2/3 resistant USP5-K113R mutant, indicating that SUMO2/3 modification of USP5 reduces its affinity for the calcium channel Cav3.2. Collectively, our data suggest that dysregulation of USP5 SUMOylation after peripheral nerve injury may contribute to the well described alteration in Cav3.2 channel activity during neuropathic pain states.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,717

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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