Bacteria- and temperature-regulated peptides modulate beta-catenin signaling in <i>Hydra</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Animal development has traditionally been viewed as an autonomous process directed by the host genome. But in many animals biotic and abiotic cues, like temperature and bacterial colonizers, provide signals for multiple developmental steps. Hydra offers unique features to encode these complex interactions of developmental processes with biotic and abiotic factors. Here, we used the model animal Hydra to investigate the impact of bacterial colonizers and temperature on the pattern formation process. In Hydra , formation of the head organizer involves the canonical Wnt pathway. Treatment with alsterpaullone (ALP) results in acquiring characteristics of the head organizer in the body column. Intriguingly, germ-free Hydra polyps are significantly more sensitive to ALP compared to control polyps. In addition to microbes, β-catenin dependent pattern formation is also affected by temperature. Gene expression analyses led to the identification of two small secreted peptides, named Eco1 and Eco2, being upregulated in the response to both, Curvibacter sp, the main bacterial colonizer of Hydra , and low temperatures. Loss-of function experiments revealed that Eco peptides are involved in the regulation of pattern formation and have an antagonistic function to Wnt signaling in Hydra .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».