Limitations of the Avp-IRES2-Cre (JAX #023530) and Vip-IRES-Cre (JAX #010908) Models for Chronobiological Investigations
Notice bibliographique
Résumé
The principal circadian pacemaker in mammals, the suprachiasmatic nucleus (SCN), expresses a number of neuropeptides that facilitate intercellular synchrony, helping to generate coherent outputs to peripheral clocks throughout the body. In particular, arginine vasopressin (AVP)– and vasoactive intestinal peptide (VIP)–expressing neurons have been recognized as crucial subpopulations within the SCN and have thus been the focus of many chronobiological studies. Here, we analyze the neuropeptide expression of 2 popular transgenic mouse strains commonly used to direct or restrict Cre-mediated recombination to AVP- and VIP-ergic neurons. The Avp-IRES2-Cre (JAX #023530) and Vip-IRES-Cre (JAX #010908) “driver” mouse strains express the Cre recombinase under the control of the endogenous Avp or Vip gene, respectively, allowing scientists either to ablate their gene of interest or to overexpress a transgene in a cell type–specific manner. Although these are potentially very powerful tools for chronobiologists and other scientists studying AVP- and VIP-ergic neurons, we found that neuropeptide expression in these mice is significantly decreased when an IRES(2)-Cre cassette is inserted downstream of the neuropeptide-encoding gene locus. The impact of IRES(2)-Cre cassette insertion on neuropeptide expression may be a confounding factor in many experimental designs. Our findings suggest that extreme caution must be exercised when using these mouse models to avoid misinterpretation of empirical results.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».