MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2970501789 · doi:10.1038/s41398-019-0532-4

The schizophrenia genetics knowledgebase: a comprehensive update of findings from candidate gene studies

2019· review· en· W2970501789 sur OpenAlexafffund
Chenxing Liu, Tetsufumi Kanazawa, Ye Tian, Suriati Mohamed Saini, Serafino G. Mancuso, Md Shaki Mostaid, Atsushi Takahashi, Dai Zhang, Fuquan Zhang, Hao Yu, Hyoung Doo Shin, Hyun Sub Cheong, Masashi Ikeda, Michiaki Kubo, Nakao Iwata, Sung‐Il Woo, Weihua Yue, Yoichiro Kamatani, Yongyong Shi, Zhiqiang Li, Ian Everall, Christos Pantelis, Chad Bousman

Notice bibliographique

RevueTranslational Psychiatry · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesKing's College LondonUniversiti Kebangsaan MalaysiaRIKENCumming School of Medicine, University of CalgaryProgram of Shanghai Subject Chief ScientistNational Health and Medical Research CouncilPeking UniversityMcGovern Institute for Brain Research, Massachusetts Institute of TechnologyShanghai Jiao Tong UniversityFujita Health UniversityGovernment of Jiangsu ProvinceNanjing Medical UniversityJining Medical UniversityNational Program for Support of Top-notch Young ProfessionalsAlberta Children's Hospital FoundationSouth London and Maudsley NHS Foundation TrustNational Cerebral and Cardiovascular CenterShanghai Education Development FoundationChildren’s Hospital of Wisconsin Research InstituteShanghai Municipal Education CommissionNational Key Research and Development Program of ChinaNorthwestern UniversitySogang UniversityNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésSchizophrenia (object-oriented programming)Psychiatric geneticsGeneticsCandidate geneComputational biologyGenePsychiatryPsychologyMedicineBiologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Over 3000 candidate gene association studies have been performed to elucidate the genetic underpinnings of schizophrenia. However, a comprehensive evaluation of these studies' findings has not been undertaken since the decommissioning of the schizophrenia gene (SzGene) database in 2011. As such, we systematically identified and carried out random-effects meta-analyses for all polymorphisms with four or more independent studies in schizophrenia along with a series of expanded meta-analyses incorporating published and unpublished genome-wide association (GWA) study data. Based on 550 meta-analyses, 11 SNPs in eight linkage disequilibrium (LD) independent loci showed Bonferroni-significant associations with schizophrenia. Expanded meta-analyses identified an additional 10 SNPs, for a total of 21 Bonferroni-significant SNPs in 14 LD-independent loci. Three of these loci (MTHFR, DAOA, ARVCF) had never been implicated by a schizophrenia GWA study. In sum, the present study has provided a comprehensive summary of the current schizophrenia genetics knowledgebase and has made available all the collected data as a resource for the research community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,913
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueTranslational PsychiatryMême sujetGenetic Associations and EpidemiologyTravaux en français237 207