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Enregistrement W2970612217 · doi:10.1016/j.radonc.2019.08.008

Sensitivity of radiomic features to inter-observer variability and image pre-processing in Apparent Diffusion Coefficient (ADC) maps of cervix cancer patients

2019· article· en· W2970612217 sur OpenAlexafffund
Alberto Traverso, Michal Kazmierski, Mattea Welch, Jessica Weiss, Sandra Fiset, Warren D. Foltz, Adam Gladwish, André Dekker, David A. Jaffray, Leonard Wee, Kathy Han

Notice bibliographique

RevueRadiotherapy and Oncology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesPrincess Margaret Cancer Foundation
Mots-clésEffective diffusion coefficientSensitivity (control systems)CervixMedicineObserver (physics)Diffusion MRIDiffusion imagingNuclear medicineCancerRadiologyArtificial intelligenceComputer scienceInternal medicineMagnetic resonance imagingPhysicsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The aims of this study are to evaluate the stability of radiomic features from Apparent Diffusion Coefficient (ADC) maps of cervical cancer with respect to: (1) reproducibility in inter-observer delineation, and (2) image pre-processing (normalization/quantization) prior to feature extraction. MATERIALS AND METHODS: Two observers manually delineated the tumor on ADC maps derived from pre-treatment diffusion-weighted Magnetic Resonance imaging of 81 patients with FIGO stage IB-IVA cervical cancer. First-order, shape, and texture features were extracted from the original and filtered images considering 5 different normalizations (four taken from the available literature, and one based on urine ADC) and two different quantization techniques (fixed-bin widths from 0.05 to 25, and fixed-bin count). Stability of radiomic features was assessed using intraclass correlation coefficient (ICC): poor (ICC < 0.75); good (0.75 ≤ ICC ≤ 0.89), and excellent (ICC ≥ 0.90). Dependencies of the features with tumor volume were assessed using Spearman's correlation coefficient (ρ). RESULTS: The approach using urine-normalized values together with a smaller bin width (0.05) was the most reproducible (428/552, 78% features with ICC ≥ 0.75); the fixed-bin count approach was the least (215/552, 39% with ICC ≥ 0.75). Without normalization, using a fixed bin width of 25, 348/552 (63%) of features had an ICC ≥ 0.75. Overall, 26% (range 25-30%) of the features were volume-dependent (ρ ≥ 0.6). None of the volume-independent shape features were found to be reproducible. CONCLUSION: Applying normalization prior to features extraction increases the reproducibility of ADC-based radiomics features. When normalization is applied, a fixed-bin width approach with smaller widths is suggested.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,040
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,990
Score d'incertitude au seuil0,054

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,040
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations73
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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