MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2970783342 · doi:10.1200/jco.2013.31.15_suppl.e16044

Impact of a genomic classifier of metastatic risk on treatment recommendations post-radical prostatectomy: Report from the DECIDE study group.

2013· article· en· W2970783342 sur OpenAlexaff
Ketan K. Badani, Darby J. S. Thompson, Christine Buerki, Elai Davicioni, Jill Garrison, Mercedeh Ghadessi, Anirban P. Mitra, Penelope J. Wood, John Hornberger

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensGenome British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineProstatectomyProstate cancerBiochemical recurrenceOncologyInternal medicineMetastasisPopulationCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e16044 Background: Only a minority of prostate cancer patients with adverse pathology and biochemical recurrence (BCR) post radical prostatectomy (RP) experience metastasis and die from prostate cancer. Improved risk prediction models using genomic information may enable clinicians to better weigh the risk of metastasis and the morbidity and costs of treatment in a clinically heterogeneous population. We present a clinical utility study that evaluates the influence on urologist treatment recommendations for patients at risk of metastasis using a genomic-based prediction model (Decipher). Methods: A prospective, pre-post design was used to assess urologist treatment recommendations following RP in both the adjuvant (without any evidence of PSA rise) and salvage (BCR) settings. Urologists were presented de-identified pathology reports and genomic classifier (GC) test results for 24 patients from a previously conducted GC validation study in high-risk post RP men. Participants were fellowship trained, high-volume urologic oncologists (n=21) from 18 US institutions. Treatment recommendations for secondary therapy were made based solely on clinical information (pre-GC) and then with genomic biomarker information (post-GC). This study was approved by an independent IRB. Results: Treatment recommendations changed from pre-GC to post- GC in 43% of adjuvant, and in 53% of salvage setting case evaluations. In the adjuvant setting, urologists changed their treatment recommendations from treatment (i.e. radiation and/or hormones) to close observation post-GC in 27% of cases. However, for cases with low GC risk (<3% risk of metastasis), 79% of these men were recommended for observation post-GC. Consistent trends were observed in the salvage setting including 24% patients with low GC risk recommended for observation even after BCR. Conclusions: These results indicate that urologists across a range of practice settings are likely to change many treatment decisions when presented with genomic biomarker information following RP. Implementation of the GC test into routine clinical practice may better direct treatment decision-making post-RP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,044
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,088

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,044
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,207
Tête enseignante GPT0,535
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical Oncology→Même sujetProstate Cancer Treatment and Research→Travaux en français237 207→