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Enregistrement W2970805220 · doi:10.1093/jxb/erz397

Distinct metabolic pathways drive monoterpenoid biosynthesis in a natural population of Pelargonium graveolens

2019· article· en· W2970805220 sur OpenAlexafffund
Matthew E. Bergman, Ángel Chávez, Albert Ferrer, Michael A. Phillips

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMonoterpeneGeraniolPulegoneCitronellolChemotypeCarvoneBotanyTerpenePopulationChemistryPelargoniumBiologyBiosynthesisSesquiterpeneLimoneneBiochemistryEssential oilEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pelargonium graveolens is a wild predecessor to rose-scented geranium hybrids prized for their essential oils used as fragrances and flavorings. However, little is known about their biosynthesis. Here we present metabolic evidence that at least two distinct monoterpene biosynthetic pathways contribute to their volatile profiles, namely, cyclic p-menthanes such as (-)-isomenthone and acyclic monoterpene alcohols such as geraniol and (-)-citronellol and their derivatives (referred to here as citronelloid monoterpenes). We established their common origin via the 2C-methyl-d-erythritol-4-phosphate pathway but found no indication these pathways share common intermediates beyond geranyl diphosphate. Untargeted volatile profiling of 22 seed-grown P. graveolens lines demonstrated distinct chemotypes that preferentially accumulate (-)-isomenthone, geraniol, or (-)-citronellol along with approximately 85 minor volatile products. Whole plant 13CO2 isotopic labeling performed under physiological conditions permitted us to measure the in vivo rates of monoterpenoid accumulation in these lines and quantify differences in metabolic modes between chemotypes. We further determined that p-menthane monoterpenoids in Pelargonium are likely synthesized from (+)-limonene via (+)-piperitone rather than (+)-pulegone. Exploitation of this natural population enabled a detailed dissection of the relative rates of competing p-menthane and citronelloid pathways in this species, providing real time rates of monoterpene accumulation in glandular trichomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,588

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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