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Enregistrement W2970909810 · doi:10.1111/tmi.13305

Population‐based prevalence of human T‐lymphotropic virus type 1 in sub‐Saharan Africa: a systematic review and meta‐analysis

2019· review· en· W2970909810 sur OpenAlexaff
Alain M. Ngoma, Magot Diata Omokoko, Paulin B. Mutombo, Eddy S. Mvika, Jérémie Muwonga, Kenneth E. Nollet, Hitoshi Ohto

Notice bibliographique

RevueTropical Medicine & International Health · 2019
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and Retrovirus Studies
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTropical spastic paraparesisMedicineMeta-analysisSeroprevalencePopulationDemographySystematic reviewCochrane LibraryPublic healthPsychological interventionInternal medicineMEDLINEImmunologyMyelopathyEnvironmental healthSerologyBiologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Human T-cell lymphotropic virus type 1 (HTLV-1), the causative agent of adult T-cell leukaemia/lymphoma (ATL) and HTLV-1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis (HAM/TSP), is endemic in sub-Saharan Africa (SSA) and poses a high morbidity and mortality risk. Its prevalence in the general population is poorly understood. The potential for prevention motivated us to do a systematic review and meta-analysis of population-based studies to estimate the prevalence of HTLV-1 in SSA. METHODS: A comprehensive, no-limit search was conducted in EMBASE, PubMed, Web of Science and the Cochrane Library from their inception dates to March 2019. Population-based studies presenting data on HTLV-1 in sub-Saharan Africa were included. Pooled prevalence was estimated using a random-effects meta-analysis. RESULTS: A total of 21 studies were included, representing 42 297 participants. The pooled HTLV-1 seroprevalence was 3.19% (95% CI 2.36-4.12%) with variations across year of study. Prevalence of HTLV-1 positively correlated with year of study (β = 0.0036, P = 0.007). Participants from Central, Western and Southern Africa had a seroprevalence of 4.16% (95% CI 2.43-6.31%), 2.66% (95% CI 1.80-3.68%) and 1.56% (95% CI 0.48-3.15%), respectively. CONCLUSIONS: Our findings suggest that HTLV-1 infection is a public health concern in SSA and highlight the need to implement effective preventive programmes and interventions aimed at reducing the burden of this common yet neglected infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,031
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,063

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,031
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0190,032
Bibliométrie0,0080,010
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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