Population Genetics of Bowfins (Amiidae) across the Laurentian Great Lakes
Notice bibliographique
Résumé
The Bowfin, Amia calva (Linneaus, 1766), is a common Eastern North American fish and the last extant member of the order Amiiformes. By 1870, thirteen species of bowfin had been described across North America. These species included Amia ocellicauda from Georgian Bay in Lake Huron (Todd, in Richardson, 1836), A.occidentalis from St. Mary’s River in Lake Huron (Dekay, 1842), A. canina from Lake Erie (Cuvier and Valenciennes, 1847) and the first-described bowfin, A. calva, from Charleston, South Carolina. This diversity was condensed down to a single species, A. calva, by Jordan and Evermann in 1896. Since then, this monotypy hypothesis has been generally accepted, but never scientifically validated. In 2014, this hypothesis was challenged when specimens from the Savanah River and Lake Ontario basins were compared morphometrically (Clifford, 2014). Results from this study concluded that there were in fact 2 distinct species. Fish from the Savanah River basin should be referred to as Amia calva and those from Lake Ontario as Amia species incertae sedis. Our study continues the testing of the monotypy hypothesis using molecular biology. Analysis of the barcoding gene Cythochrome Oxidase I is being used to phylogenetically compare specimens collected from Lake Huron, Lake Erie, and the Carolinas. Sanger sequencing of this gene has allowed us to properly align and genetically classify fish from each locality. As a result, we can then begin to delineate potential species and improve taxonomic classification. Data collected from our study is also being used to complement morphometric data and eventually shed light on a subject which has been untouched for almost 120 years.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».