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Enregistrement W2971471374 · doi:10.1017/cjn.2019.271

Clinical, neuropathological and molecular features of fatal human pegivirus-associated encephalitis

2019· article· en· W2971471374 sur OpenAlexaffvenue
LM Schmitt, Erin F. Balcom, Matthew A. L. Doan, WG Branton, Juan Jovel, Gregg Blevins, Beste Edguer, TC Hobman, Elaine Yacyshyn, Derek Emery, Adrian Box, Christopher Power, FKH van Landeghem

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensWomen and Children’s Health Research InstituteUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEncephalitisPathologyVirologyBiologyMedicineVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Flaviviruses include many viruses causing encephalitis, including West Nile encephalitis, St. Louis encephalitis, tick-borne encephalitis and Japanese encephalitis. Human pegivirus genotype-1 (HPgV-1) is a lesser known member of the Flaviviridae family and has been identified in human serum, cerebrospinal fluid and brain tissue. Here, we describe two adult patients with fatal HPgV-1-associated encephalitis. Neuroimaging revealed multifocal lesions, initially present in the periventricular and brain stem white matter, then one year later throughout the corona radiata bilaterally with marked involvement of the brainstem and cervical spinal cord. Phylogenetic analyses of HPgV-1 showed clustering of brain-derived sequences from both patients with other human pegiviruses. In both patients, a novel 87-nucleotide deletion in the viral NS2 gene was detected. The presence of positive and negative strand HPgV-1 RNA and viral antigens in both patients indicated viral persistence and replication in the CNS. Autopsy showed lymphocyte infiltration and gliosis predominantly in white matter of the brain and brain stem but, to a lesser extent, also in grey matter. Immunofluorescence revealed HPgV-1 NS5A antigen in lymphocytes as well as in astrocytes and oligodendrocytes. Thus, we hypothesize that the novel deletion in the NS2 coding region may have caused HPgV-1 neuroadaptation or might represent a yet unrecognized genotype of human pegivirus. LEARNING OBJECTIVES This presentation will enable the learner to: 1. Describe the clinical and neuropathological features of fatal human pegivirus-associated encephalitis 2. Recognize the importance of molecular analysis in encephalitis cases with unknown etiology

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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