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Enregistrement W2971478287 · doi:10.24425/118054

Molecular Cloning and Expression Analysis of CML27 in Brassica oleracea Pollination Process

2018· article· en· W2971478287 sur OpenAlexaff
Xiao Ping Lian, Jing Zeng, He Cui Zhang, Xiao Yang, Liang Zhao, Li Quan Zhu

Notice bibliographique

RevueActa Biologica Cracoviensia s Botanica · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesSouthwest UniversityNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyBrassica oleraceaPollinationCloning (programming)BrassicaPlant scienceBotanyComputational biologyPollen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To keep genetic diversity, flowering plants have developed a self-incompatibility system, which can prevent self-pollination. It has been reported that calcium concentration in pistil papilla cells was increased after self-pollination in transformed self-incompatible Arabidopsis thaliana. In this study, we found that CML27 changed its expression level for both mRNA and protein when compared to transcriptome and proteome. At the same time, CML27 was expressed in the anther and pistil at a high level and reached up to 5-fold up-regulated expression in the pistil at 1 h post-pollination when compared to 0 min. In order to find out potential proteins that may interact with BoCML27, BoCML27 was expressed in and isolated from E. coli. After its co-incubation with Brassica oleracea pistil proteins, the products were separated on SDS-PAGE gels. We found a specific band at the position between 130–180 kDa. Through LC-MS-MS (Q-TOF) analysis, eight proteins were identified from the band. The proteins include 26S proteasome non-ATPase regulatory (26S), Phospholipase D, alpha 2 (PLDα2) involved in Ca2+ binding and Coatomer subunit alpha-2-like (Coatomer) involved in vesicle mediated transport. All of these identified proteins provide new insights for the self-incompatibility response in B. oleracea, specific for increasing Ca2+ concentration in pistil papilla cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,108
Score d'incertitude au seuil0,671

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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