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Enregistrement W2971651173 · doi:10.1101/757864

Loss of Cdc13 causes genome instability by a deficiency in replication-dependent telomere capping

2019· preprint· en· W2971651173 sur OpenAlexaff
Rachel E. Langston, Dominic Palazzola, Erin Bonnell, Raymund J. Wellinger, Ted Weinert

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésTelomereHomologous chromosomeChromosomeBiologyChromosome instabilityHomologous recombinationDNA replicationGenome instabilityGeneticsGenomeTelomere-binding proteinDNAGeneDNA-binding proteinDNA damage

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In budding yeast, Cdc13, Stn1, and Ten1 form a telomere binding heterotrimer dubbed CST. Here we investigate the role of Cdc13/CST in maintaining genome stability, using a Chr VII disome system that can generate recombinants, loss, and enigmatic unstable chromosomes. In cells expressing a temperature sensitive CDC13 allele, cdc13 F684S , unstable chromosomes frequently arise due to problems in or near a telomere. Hence, when Cdc13 is defective, passage through S phase causes Exo1-dependent ssDNA and unstable chromosomes, which then are the source for whole chromosome instability events (e.g. recombinants, chromosome truncations, dicentrics, and/or loss). Specifically, genome instability arises from a defect in Cdc13’s replication-dependent telomere capping function, not Cdc13s putative post-replication telomere capping function. Furthermore, the unstable chromosomes form without involvement of homologous recombination nor non-homologous end joining. Our data suggest that a Cdc13/CST defect in semi-conservative replication near the telomere leads to ssDNA and unstable chromosomes, which then are lost or subject to complex rearrangements. This system defines a links between replication-dependent chromosome capping and genome stability in the form of unstable chromosomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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