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Enregistrement W2971855304 · doi:10.1161/hyp.74.suppl_1.p150

Abstract P150: Genes of a Brown Norway Chromosome 2 Fragment Introgressed Into Hypertensive Dahl Salt-Sensitive Background Exert Pro-Inflammatory Effects When Stimulated by a High-Salt Diet

2019· article· en· W2971855304 sur OpenAlexaff
Olga Berillo, Sofiane Ouerd, Ku-Geng Huo, Asia Rehman, Chantal Richer, Daniel Sinnett, Anne E. Kwitek, Pierre Paradis, Ernesto L. Schiffrin

Notice bibliographique

RevueHypertension · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInflammationInternal medicineEndocrinologyBlood pressureMonocyteBiologyGene expressionGeneMolecular biologyMedicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Chromosome 2 (Chr2) introgression from normotensive Brown Norway (BN) rats into hypertensive Dahl salt-sensitive (SS) background (consomic S B 2) reduced blood pressure (BP) and vascular inflammation under normal-salt diet (NSD). We hypothesized that BN Chr2 contains anti-inflammatory genes that could reduce BP elevation and vascular inflammation in rats fed NSD and high-salt diet (HSD). Method: Four- to 6-week old male SS and congenic rats containing the BN Chr2 distal portion (S B 2a) and middle segment (S B 2b) were fed NSD or HSD (4% NaCl) for 8 weeks. We determined systolic BP (SBP) by telemetry, reactive oxygen species (ROS) generation using dihydroethidium staining, and vascular cell adhesion molecule 1 (VCAM-1), monocyte chemoattractant protein-1 (MCP-1) expression and monocyte/macrophage (MoMϕ) infiltration by immunofluorescence in aorta or perivascular fat (PVAT). RNA was extracted from aorta and used for small and total RNA sequencing and data were analyzed using a systems biology approach. Differentially expressed genes (DEGs) were identified with fold change >1.3 and fold discovery rate <0.05 and some of them were validated with RT-qPCR. Results: SS SBP was 145±2 mm Hg under NSD and 168±1 mm Hg under HSD, which was lower in S B 2a and S B 2b SBP (125±3 and 127±6, P <0.05) under NSD but similar under HSD. Examination of ROS generation, VCAM-1 and MCP-1 expression and MoMϕ infiltration revealed that S B 2a present less and more inflammation under NSD and HSD, respectively, compared to SS. DEGs were identified in S B 2a vs SS uniquely under NSD (15↑ and 8↓) and HSD (318↑ and 221↓) and under both diet (3↑ and 3↓), and in S B 2b vs SS uniquely under NSD (43↑ and 65↓) and HSD (4↑ and 7 ↓) and under both diet (3↑ and 4 ↓). DEGs encoded within BN Chr2a were uniquely identified under NSD (1↑ and 1↓) and HSD (6↑ and 1↓), and in both diets (1↑ and 1↓). Gene enrichment analysis revealed that under NSD, 2 BN Chr2a DEGs are involved in regulation of BP, and under HSD, 7 BN Chr2a DEGs in cell proliferation, cell differentiation, signal transduction and the immune system. RT-qPCR validated DEGs encoded within BN Chr2a under NSD (2) and HSD (4). Conclusions: DEGs encoded within BN Chr2a fragment are associated with anti- and pro-inflammatory effects under NSD and HSD, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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