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Enregistrement W2971858533 · doi:10.1017/cjn.2019.266

NTRK2 Fusion Driven Pediatric Glioblastoma: Identification of key molecular drivers by personalized oncology

2019· article· en· W2971858533 sur OpenAlexaffvenue
Levine, Yaoqing Shen, Karen Mungall, Jonathan Serrano, Matija Snuderl, Erin Pleasance, Sjm Jones, Janessa Laskin, MA Marra, Shahrad R. Rassekh, Rebecca Deyell, Stephen Yip, Sylvia Cheng, Christopher Dunham

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensChildren's & Women's Health Centre of British ColumbiaBC Children's HospitalBC Cancer AgencyCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésATRXMedicineOncologyPersonalized medicineInternal medicineBioinformaticsCancer researchBiologyGeneticsGeneMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We describe the case of an 11-month-old girl with a rare cerebellar glioblastoma driven by a NACC2-NTRK2 (Nucleus Accumbens Associated Protein 2-Neurotrophic Receptor Tyrosine Kinase 2) fusion. Initial workup of our case demonstrated homozygous CDKN2A deletion, but immunohistochemistry for other driver mutations, including IDH1 R132H, BRAF V600E, and H3F3A K27M were negative, and ATRX was retained. Tissue was subsequently submitted for personalized oncogenomic analysis, including whole genome and whole transcriptome sequencing, which demonstrated an activating NTRK2 fusion, as well as high PD-L1 expression, which was subsequently confirmed by immunohistochemistry. Furthermore, H3 and IDH demonstrated wildtype status. These findings suggested the possibility of treatment with either NTRK- or immune checkpoint- inhibitors through active clinical trials. Ultimately, the family pursued standard treatment that involved Head Start III chemotherapy and proton radiotherapy. Notably, at most recent follow upapproximately two years from initial diagnosis, the patient is in disease remission and thriving, suggesting favorable biology despite histologic malignancy. This case illustrates the value of personalized oncogenomics, as the molecular profiling revealed two actionable changes that would not have been apparent through routine diagnostics. NTRK fusions are known oncogenic drivers in a range of cancer types, but this is the first report of a NACC2-NTRK2 fusion in a glioblastoma. LEARNING OBJECTIVES This presentation will enable the learner to: 1. Explore the current molecular landscape of pediatric high grade gliomas 2. Recognize the value of personalized oncogenomic analysis, particularly in rare and/or aggressive tumors 3. Discuss the current status of NTRK inhibitor clinical trials

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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