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Enregistrement W2971903263 · doi:10.1073/pnas.1905298116

Extreme heterogeneity in sex chromosome differentiation and dosage compensation in livebearers

2019· article· en· W2971903263 sur OpenAlex
Iulia Darolti, Alison E. Wright, Benjamin A. Sandkam, Jake Morris, Natasha I. Bloch, Marta Farré, Rebecca C. Fuller, Godfrey R. Bourne, Denis M. Larkin, Felix Breden, Judith E. Mank

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFP7 Ideas: European Research CouncilBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNatural Environment Research CouncilResearch Councils UKSight Research UK
Mots-clésPoeciliidaeBiologyPoeciliaDosage compensationChromosomeY chromosomeEvolutionary biologyGeneticsX chromosomeCladeLineage (genetic)Evolution of sexual reproductionGenePhylogeneticsFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Once recombination is halted between the X and Y chromosomes, sex chromosomes begin to differentiate and transition to heteromorphism. While there is a remarkable variation across clades in the degree of sex chromosome divergence, far less is known about the variation in sex chromosome differentiation within clades. Here, we combined whole-genome and transcriptome sequencing data to characterize the structure and conservation of sex chromosome systems across Poeciliidae, the livebearing clade that includes guppies. We found that the Poecilia reticulata XY system is much older than previously thought, being shared not only with its sister species, Poecilia wingei , but also with Poecilia picta , which diverged roughly 20 million years ago. Despite the shared ancestry, we uncovered an extreme heterogeneity across these species in the proportion of the sex chromosome with suppressed recombination, and the degree of Y chromosome decay. The sex chromosomes in P. reticulata and P. wingei are largely homomorphic, with recombination in the former persisting over a substantial fraction. However, the sex chromosomes in P. picta are completely nonrecombining and strikingly heteromorphic. Remarkably, the profound degradation of the ancestral Y chromosome in P. picta is counterbalanced by the evolution of functional chromosome-wide dosage compensation in this species, which has not been previously observed in teleost fish. Our results offer important insight into the initial stages of sex chromosome evolution and dosage compensation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,355
Score d'incertitude au seuil0,171

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle