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Enregistrement W2972012530 · doi:10.1139/cjm-2019-0114

Reverse transcription – loop-mediated isothermal amplification assay for the rapid detection of pathogenic <i>Listeria monocytogenes</i> in meat products

2019· article· en· W2972012530 sur OpenAlexvenueno aff
Lingzhi Zhan, Dafeng Song, Qing Gu, Tingting Yan, Congcong Ma

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiosensors and Analytical Detection
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFood Science and Engineering, the Most Important Discipline of Zhejiang ProvinceNatural Science Foundation of Zhejiang ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésLoop-mediated isothermal amplificationListeria monocytogenesAgarose gel electrophoresisMolecular biologyAgaroseChemistryRaw meatBiologyDNAChromatographyFood scienceMicrobiologyBacteriaBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study reports the use of reverse transcription – loop-mediated isothermal amplification (RT–LAMP) to detect Listeria monocytogenes in meat. The assay was designed to target the iap gene of L. monocytogenes, to which four primers, recognizing six distinct iap sites, were designed. We optimized the RT–LAMP conditions and established the following optimal systems: 60 min, 63 °C, 2.0 mmol/L MgSO4, 1.0 mol/L betaine, 2.0 mmol/L dNTPs, 320 U/mL Bst DNA polymerase, 0.4 μmol/L outer primers, and 0.8 μmol/L inner primers. The RT–LAMP amplification products were identified by a visible white Mg2P2O7 precipitate or electrophoresis on a 2% agarose gel. RT–LAMP has a sensitivity of 7.3 × 101 CFU/mL, which is 2-fold higher than that of LAMP. When commercially available raw meat samples (including beef, pork, mutton, and rabbit) were analyzed simultaneously with RT–LAMP and the Chinese National Standard GB 4789.30-2016, their abilities to detect L. monocytogenes were the same. Samples containing L. monocytogenes killed by 15 psi at 121 °C for 15 min were used to confirm the specificity of RT–LAMP for live microorganisms. Thus, we used RT–LAMP to efficiently detect L. monocytogenes in meat products.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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