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Enregistrement W2972211557 · doi:10.1039/c9ob01711a

Melioidosis patient serum-reactive synthetic tetrasaccharides bearing the predominant epitopes of<i>Burkholderia pseudomallei</i>and<i>Burkholderia mallei</i>O-antigens

2019· article· en· W2972211557 sur OpenAlexafffund
Maude Cloutier, Emmanilo Delar, Kevin Muru, Seynabou Ndong, Robert R. Hoyeck, Taniya Kaewarpai, Narisara Chantratita, Mary N. Burtnick, Paul J. Brett, Charles Gauthier

Notice bibliographique

RevueOrganic & Biomolecular Chemistry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBurkholderia infections and melioidosis
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMelioidosisBurkholderia pseudomalleiMicrobiologyAntigenicityBurkholderiaEpitopeGlycosylationBacteriaAntigenBiologyImmunologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Melioidosis and glanders, respectively caused by the Gram-negative bacteria Burkholderia pseudomallei (Bp) and Burkholderia mallei (Bm), are considered as urgent public health issues in developing countries and potential bioterrorism agents. Bp and Bm lipopolysaccharides (LPS) have been identified as attractive vaccine candidates for the development of prophylactic measures against melioidosis and glanders. Bp and Bm express structurally similar LPSs wherein the O-antigen (OAg) portion consists of a heteropolymer whose repeating unit is a disaccharide composed of d-glucose and 6-deoxy-l-talose residues, the latter being diversely acetylated and methylated. Herein we report the synthesis of two tetrasaccharides mimicking the main substitution epitopes of Bp and Bm LPS OAgs. The assembly of the tetrasaccharides was achieved using a sequential glycosylation strategy while relying on the late-stage epimerization of the inner rhamnose into a 6-deoxy-l-talose residue. We show that these synthetic compounds strongly react with culture-confirmed Thai melioidosis patient serum and closely mimic the antigenicity of native Bp OAg. Our results suggest that these tetrasaccharides could be suitable candidates for the development of vaccines and/or diagnostic tools against melioidosis and glanders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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