MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2972312524 · doi:10.48550/arxiv.1911.12254

A semi-autonomous approach to connecting proprietary EHR standards to FHIR

2019· article· en· W2972312524 sur OpenAlexaff
Martin Chapman, Vasa Ćurčin, Elizabeth Sklar

Notice bibliographique

RevuearXiv (Cornell University) · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueSemantic Web and Ontologies
Établissements canadiensInstitute of Population and Public Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInteroperabilityComputer scienceData exchangeElectronic data interchangeInterface (matter)Semantic interoperabilitySoftware engineeringSchema (genetic algorithms)SoftwareProcess (computing)DatabaseWorld Wide WebInformation retrievalProgramming language

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HL7's Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) standard is designed to provide a consistent way in which to represent and exchange healthcare data, such as electronic health records (EHRs). SMART--on--FHIR (SoF) technology uses this standard to augment existing healthcare data systems with a standard FHIR interface. While this is an important goal, little attention has been paid to developing mechanisms that convert EHR data structured using proprietary schema to the FHIR standard, in order to be served by such an interface. In this paper, a formal process is proposed that both identifies a set of FHIR resources that best capture the elements of an EHR, and transitions the contents of that EHR to FHIR, with a view to supporting the operation of SoF containers, and the wider interoperability of health records with the FHIR standard. This process relies on a number of techniques that enable us to understand when two terms are equivalent, in particular a set of similarity metrics, which are combined along with a series of parameters in order to enable the approach to be tuned to the different EHR standards encountered. Thus, when realised in software, the translation process is semi-autonomous, requiring only the specification of these parameters before performing an arbitrary number of future conversions. The approach is demonstrated by utilising it as part of the CONSULT project, a wider decision support system that aims to provide intelligent decision support for stroke patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,036
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,037
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,193

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0360,037
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0040,012
Communication savante0,0120,017
Science ouverte0,0050,013
Intégrité de la recherche0,0050,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,185
Écart entre enseignants0,141 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuearXiv (Cornell University)Même sujetSemantic Web and OntologiesTravaux en français237 207