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Enregistrement W2972349200 · doi:10.1007/978-3-030-30493-5_72

Characterization of Quantum Derived Electronic Properties of Molecules: A Computational Intelligence Approach

2019· book-chapter· en· W2972349200 sur OpenAlexaff
Julio J. Valdés, Alain Tchagang

Notice bibliographique

RevueLecture notes in computer science · 2019
Typebook-chapter
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceArtificial neural networkCluster analysisBlack boxArtificial intelligenceComputational intelligenceComputational complexity theoryUnsupervised learningMachine learningResidualSet (abstract data type)AlgorithmTheoretical computer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The availability of BIG molecular databases derived from quantum mechanics computations represent an opportunity for computational intelligence practitioners to develop new tools with same accuracy but much lower computational complexity compared to the costly Schrödinger equation. In this study, unsupervised and supervised learning methods are applied to investigate the internal structure of the data and to learn the mapping between the atomic coordinates of molecules and their properties. Low dimensional spaces revealed a well defined clustering structure as defined by the measures used for comparing molecules based their atom distributions and chemical composition. Supervised learning techniques were applied on the original predictor variables, as well as on a subset of selected variables found using evolutionary algorithms guided by residual variance analysis (Gamma Test). Black and white box modeling approaches were used (random forests, neural networks and model trees and adaptive regression respectively). All of them delivered good performance, error and correlation-wise, with neural networks producing the best results. In particular white box techniques obtained explicit functional dependencies, some of them achieving considerably reduction of the feature set and expressed as simple models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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