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Enregistrement W2972394532 · doi:10.3390/biom9090489

Detection and Identification of Allergens from Canadian Mustard Varieties of Sinapis alba and Brassica juncea

2019· article· en· W2972394532 sur OpenAlex
Lamia L’Hocine, Mélanie Pitre, Allaoua Achouri

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueBiomolecules · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFood Allergy and Anaphylaxis Research
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésSinapisBrassicaImmunoglobulin EMustard PlantAllergenChemistryBiochemistryEpitopeBiologyBotanyAntibodyImmunologyAllergy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Currently, information on the allergens profiles of different mustard varieties is rather scarce. Therefore, the objective of this study was to assess protein profiles and immunoglobulin E (IgE)-binding patterns of selected Canadian mustard varieties. Optimization of a non-denaturing protein extraction from the seeds of selected mustard varieties was first undertaken, and the various extracts were quantitatively and qualitatively analyzed by means of protein recovery determination and protein profiling. The IgE-binding patterns of selected mustard seeds extracts were assessed by immunoblotting using sera from mustard sensitized and allergic individuals. In addition to the known mustard allergens—Sin a 2 (11S globulins), Sin a 1, and Bra j 1 (2S albumins)—the presence of other new IgE-binding protein bands was revealed from both Sinapis alba and Brassica juncea varieties. Mass spectrometry (MS) analysis of the in-gel digested IgE-reactive bands identified the unknown ones as being oleosin, β-glucosidase, enolase, and glutathione-S transferase proteins. A bioinformatic comparison of the amino acid sequence of the new IgE-binding mustard proteins with those of know allergens revealed a number of strong homologies that are highly relevant for potential allergic cross-reactivity. Moreover, it was found that Sin a 1, Bra j 1, and cruciferin polypeptides exhibited a stronger IgE reactivity under non-reducing conditions in comparison to reducing conditions, demonstrating the recognition of conformational epitopes. These results further support the utilization of non-denaturing extraction and analysis conditions, as denaturing conditions may lead to failure in the detection of important immunoreactive epitopes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,316
Score d'incertitude au seuil0,974

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle