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Enregistrement W2972521279 · doi:10.1101/19005223

Identifying subtypes of a stigmatized medical condition

2019· preprint· en· W2972521279 sur OpenAlexaboutno aff
Irene S. Gabashvili

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueOlfactory and Sensory Function Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOdorMedicineEtiologyUrineInternal medicineClinical psychologyPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Some conditions - such as obesity, depression and functional odor disorders - come with a social stigma. Understanding the etiology of these conditions helps to avoid stereotypes and find remedies. One of the major obstacles facing researchers, especially for those studying socially distressing metabolic malodor, is the difficulty in assembling biologically homogenous study cohorts. Objective The aim of this study was to examine phenotypic variance, self-reported data and laboratory tests for the purpose of identifying clinically relevant and etiologically meaningful subtypes of idiopathic body odor and the “People are Allergic To Me” (PATM) syndrome. Methods Participants with undiagnosed body odor conditions enrolled to participate in this research study initiated by a healthcare charity MEBO Research and sponsored by Wishart Research group at the Metabolomics Innovation Centre, University of Alberta, Canada. Primary outcomes were differences in metabolite concentrations measured in urine, blood and breath of test and control groups. Principal component analyses and other statistical tests were carried out for these measurements. Results While neither of existing laboratory tests could reliably predict chronic malodor symptoms, several measurements distinguished phenotypes at a significance level less than 5%. Types of malodor can be differentiated by self-reported consumption of (or sensitivity to) added sugars (p<0.01), blood alcohols after glucose challenge (especially ethanol: p<0.0005), urinary excretion of phenylalanine, putrescine, and combinations of blood or urine metabolites. Conclusions Our preliminary results suggest that malodor heterogeneity can be addressed by analyses of phenotypes based on patients’ dietary and olfactory observations. Our studies highlight the need for more trials. Future research focused on comprehensive metabolomics and microbiome sequencing will play an important role in the diagnosis and treatment of malodor. Trial Registration The study discussed in the manuscript was registered as NCT02692495 at clinicaltrials.gov. The results were compared with our earlier study registered as NCT02683876 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,173
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,158 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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