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Enregistrement W2972616723 · doi:10.1016/j.jgr.2019.08.008

Identification of N,N′,N″-triacetylfusarinine C as a key metabolite for root rot disease virulence in American ginseng

2019· article· en· W2972616723 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueJournal of Ginseng Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGinseng Biological Effects and Applications
Établissements canadiensWestern UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesWestern UniversityMinistry of Agriculture, Food and Rural AffairsAgriculture and Agri-Food CanadaOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsUniversity of Notre Dame
Mots-clésSiderophoreGinsengVirulenceRoot rotBiologyMicrobiologySecondary metaboliteMetaboliteBotanyBacteriaMedicineGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is estimated that 20–30% of ginseng crops in Canada are lost to root rot each harvest. This disease is commonly caused by fungal infection with Ilyonectria, previously known as Cylindrocarpon. Previous reports have linked the virulence of fungal disease to the production of siderophores, a class of small-molecule iron chelators. However, these siderophores have not been identified in Ilyonectria. High-resolution LC–MS/MS was used to screen Ilyonectria and Cylindrocarpon strain extracts for secondary metabolite production. These strains were also tested for their ability to cause root rot in American ginseng and categorized as virulent or avirulent. The differences in detected metabolites between the virulent and avirulent strains were compared with a focus on siderophores. For the first time, a siderophore N,N′,N″-triacetylfusarinine C (TAFC) has been identified in Ilyonectria, and it appears to be linked to disease virulence. Siderophore production was suppressed as the concentration of iron increased, which is in agreement with previous reports. The identification of the siderophore produced by Ilyonectria gives us further insight into the root rot disease that heavily affects ginseng crop yields. This research identifies a molecular pathway previously unknown for ginseng root rot and could lead to new disease treatment options.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,538
Score d'incertitude au seuil0,362

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,364 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle