The occasional perils of reflection (across the midline; in geometric morphometrics)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Manually collecting landmark data on a large biological sample takes a long time. Several options exist to speed data collection, though each strategy introduces problems or raises concerns of its own. For bilaterally symmetric structures (e.g., crania), some recent papers recommend limiting landmark collection to one side and the midline, then “mirror-reflecting” landmarks across the midline to produce an approximation of the true bilateral configuration. However, where the midline is narrow relative to the bilateral anatomy, net midline landmark deviations from the mid-sagittal axis or plane will distort the mirror-reflected configuration. Here, I test whether this is a substantive concern at the scale of real biology. To do so, I simulate small amounts of mediolateral error on the mean shape from a sample of human mandibles ( n = 178), then compare the distribution of simulated forms to variation in the data. I also test how faithfully mirror-reflected configurations replicate bilateral shape and size relationships. In both analyses, midline deviations from symmetry create striking distortions. I go on to show that incorporating a small number of landmarks from the opposite side of the mandible produces far more accurate estimates of bilateral shape than does mirror reflection. Mirror reflection is clearly inappropriate for these data and is likely suspect in all cases of narrow midline morphology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,022 | 0,072 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,006 |
| Communication savante | 0,002 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».