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Enregistrement W2972929611 · doi:10.1002/csc2.20057

Development of barley introgression lines carrying the leaf rust resistance genes <i>Rph1</i> to <i>Rph15</i>

2020· article· en· W2972929611 sur OpenAlexaff
Oswaldo Chicaiza, Juan C. Caffarel, Ahmad H. Sallam, Arnis Druka, Robbie Waugh, Frank Ordon, Doris Kopahnke, Jens Keilwagen, Dragan Perović, T. G. Fetch, Yue Jin, J. D. Franckowiak, Brian J. Steffenson

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensBrandon UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyIntrogressionHordeum vulgareRust (programming language)GermplasmPucciniaPlant disease resistanceGeneCultivarBotanyGeneticsPoaceaeMildew

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In many production areas, barley ( Hordeum vulgare L.) is attacked by the leaf rust pathogen ( Puccinia hordei Otth), a basidiomycetous fungus that reduces both its yield and quality. Many leaf rust resistance genes, known as reaction to P. hordei ( Rph ) genes, have been described in barley. To differentiate genetic variants for virulence in pathogen populations, plant pathologists use differentials (i.e., sets of host lines carrying different resistance genes). The sources of Rph1–15 were derived from cultivars, landraces, and wild barley ( H . vulgare ssp. spontaneum K. Koch) accessions with diverse geographic origins and agromorphological traits. Ideal differential sets comprise single‐gene lines backcrossed to a single adapted accession that is susceptible to all known races of a pathogen. In this study, sources of Rph1–15 and other Rph gene donors were backcrossed to the susceptible barley cultivar Bowman and then genotyped to characterize the chromosomal positions and sizes of introgressions. Overall, 95 Bowman introgression lines for leaf rust resistance were developed and characterized for their rust phenotypes and genotypes. A single line was selected to represent each of the 15 Rph genes for use as the new barley leaf rust differential set. The existence of possible new resistance genes in the studied germplasm was postulated. The new Bowman Rph1–15 differential lines will facilitate the efficient virulence phenotyping of P. hordei and serve as valuable genetic stocks for Rph gene stacking and cloning in barley.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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