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Enregistrement W2973226640 · doi:10.3168/jds.2019-16302

Modeling portal-drained viscera and liver fluxes of essential amino acids in dairy cows

2019· article· en· W2973226640 sur OpenAlexaff
Alison Fleming, H. Lapierre, R. Martineau, R.R. White, M.D. Hanigan

Notice bibliographique

RevueJournal of Dairy Science · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMean squared errorAnimal scienceMathematicsRangingPortal veinChemistryStatisticsInternal medicineBiologyMedicineGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this work was to predict essential amino acid (EAA) use and release by the portal-drained viscera (PDV) and liver of dairy cows. Previously derived equations were tested using data assembled from the literature, refit to the data, and modifications were undertaken to determine the best model for each EAA. The refitted model has the same structure as the original equations but is parameterized using a database of group means, as the original equations were derived using a single study with individual cow data and found to be biased. The PDV clearance model predicted portal vein concentrations given inputs of absorbed and arterial fluxes of EAA with root mean squared errors (RMSE) ranging from 3.3 to 12.1% of the observed means, and concordance correlation coefficients (CCC) ranging from 0.86 to 0.99 when using previously reported parameters. The reparameterized model generated from the assembled data set resulted in predictions of EAA portal vein concentrations with RMSE ranging from 3.2 to 8.6% and CCC ranging from 0.93 to 1.00. Slope bias ranged from 12.4 to 55.3% of mean squared errors and was correlated with arterial EAA concentrations. Modifying the model to allow rate constants to vary as a function of arterial EAA concentrations reduced slope bias, resulting in RMSE ranging from 1.9 to 6.5% and CCC from 0.97 to 1.00. Alternatively, splitting the model to account for use of EAA from absorption separately from arterial use resulted in poorer predictions and biologically infeasible parameter estimates. The liver clearance model predicted hepatic vein concentrations from arterial and portal vein input fluxes with RMSE across EAA ranging from 1.9 to 6.8% and CCC ranging from 0.97 to 1.00 when using reported parameters. The reparameterized model generated from the assembled data set resulted in predictions of EAA hepatic vein concentrations with RMSE ranging from 1.9 to 6.7% and CCC ranging from 0.97 to 1.00. Significant slope bias was present for Arg, His, Lys, Phe, Thr, and Val. Altering the model to represent the clearance rate constant as a function of arterial concentrations resulted in RMSE ranging from 1.8 to 6.5% and CCC ranging from 0.97 to 1.00. The combination of PDV and liver clearance models provided predictions of total splanchnic use similar to those of an empirical model representing splanchnic use as a fractional proportion of absorption that had RMSE ranging from 3.0 to 8.6% and CCC ranging from 0.95 to 0.99, with significant slope bias for the majority of EAA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,058

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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