Inter‐breed diversity and temporal dynamics of the faecal microbiota in healthy horses
Notice bibliographique
Résumé
Understanding gut microbiota similarities and differences across breeds in horses has the potential to advance approaches aimed at personalized microbial modifications, particularly those involved in improving sport athletic performance. Here, we explore whether faecal microbiota composition based on faecal 16S ribosomal RNA gene sequencing varies across six different sport breeds at two time points 8 months apart within a cohort of 189 healthy horses cared for under similar conditions. Lusitano horses presented the smallest and Hanoverians the greatest bacterial diversity. We found subtle but significant differences in β-diversity between Lusitano, Anglo Arabian and the central European breeds, and we reproduced these results across the two time points. Repeat sampling of subjects showed community to be temporally more stable in Lusitano and Anglo Arabian breeds. Additionally, we found that 27 genera significantly varied in abundance across breeds. Overall, 33% of these taxa overlapped with previously identified taxa that were associated with genetic variation in humans or other species. However, a non-significant correlation was observed between microbial composition and the host pedigree-based kinship. Despite a notable variation in the diversity and composition of the faecal microbiota, breed exerted limited effects on the equine faecal microbiota.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».